UBXN11 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

UBXN11

Ідентифікатори

Символи

UBXN11, COA-1, SOC, SOCI, UBXD5, PP2243, UBX domain protein 11

Зовнішні ІД

OMIM: 609151 MGI: 1914836 HomoloGene: 12159 GeneCards: UBXN11

Пов'язані генетичні захворювання

Онтологія гена
Молекулярна функція	• ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • цитоскелет
Біологічний процес	• proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


91544


67586

Ensembl


ENSG00000158062


ENSMUSG00000012126

UniProt


Q5T124


Q9D572

RefSeq (мРНК)


NM_183008 NM_001077262 NM_145345 NM_001389556 NM_001389559


NM_026257

RefSeq (білок)


NP_001070730 NP_663320 NP_892120


NP_080533

Локус (UCSC)

Хр. 1: 26.28 – 26.32 Mb

Хр. 4: 133.83 – 133.85 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

UBXN11 (англ. UBX domain protein 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 520 амінокислот, а молекулярна маса — 57 373^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSPLASLSK	TRKVPLPSEP	MNPGRRGIRI	YGDEDEVDML	SDGCGSEEKI
SVPSCYGGIG	APVSRQVPAS	HDSELMAFMT	RKLWDLEQQV	KAQTDEILSK
DQKIAALEDL	VQTLRPHPAE	ATLQRQEELE	TMCVQLQRQV	REMERFLSDY
GLQWVGEPMD	QEDSESKTVS	EHGERDWMTA	KKFWKPGDSL	APPEVDFDRL
LASLQDLSEL	VVEGDTQVTP	VPGGARLRTL	EPIPLKLYRN	GIMMFDGPFQ
PFYDPSTQRC	LRDILDGFFP	SELQRLYPNG	VPFKVSDLRN	QVYLEDGLDP
FPGEGRVVGR	QLMHKALDRV	EEHPGSRMTA	EKFLNRLPKF	VIRQGEVIDI
RGPIRDTLQN	CCPLPARIQE	IVVETPTLAA	ERERSQESPN	TPAPPLSMLR
IKSENGEQAF	LLMMQPDNTI	GDVRALLAQA	RVMDASAFEI	FSTFPPTLYQ
DDTLTLQAAG	LVPKAALLLR	ARRAPKSSLK	FSPGPCPGPG	PGPSPGPGPG
PSPGPGPGPS	PCPGPSPSPQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Katoh H., Harada A., Mori K., Negishi M. (2002). Socius is a novel Rnd GTPase-interacting protein involved in disassembly of actin stress fibers. Mol. Cell. Biol. 22: 2952—2964. PMID 11940653 DOI:10.1128/MCB.22.9.2952-2964.2002
Maccalli C., Li Y.F., El-Gamil M., Rosenberg S.A., Robbins P.F. (2003). Identification of a colorectal tumor-associated antigen (COA-1) recognized by CD4(+) T lymphocytes. Cancer Res. 63: 6735—6743. PMID 14583468

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з UBXN11 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30600 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q5T124 (англ.) . Архів оригіналу за 16 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.