UBR1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | UBR1, JBS, ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605981 MGI: 1277977 HomoloGene: 7582 GeneCards: UBR1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • zinc ion binding • leucine binding • зв'язування з іоном металу • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • Протеасома • гіалоплазма • ubiquitin ligase complex |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of TOR signaling • cellular response to leucine • ubiquitin-dependent protein catabolic process via the N-end rule pathway • GO:0044257 protein catabolic process • Убіквітин-залежний протеоліз • ubiquitin-dependent protein catabolic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 15: 42.94 – 43.11 Mb | Хр. 2: 120.69 – 120.8 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
UBR1 (англ. Ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 749 амінокислот, а молекулярна маса — 200 211[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MADEEAGGTE | | RMEISAELPQ | | TPQRLASWWD | | QQVDFYTAFL | | HHLAQLVPEI |
YFAEMDPDLE | | KQEESVQMSI | | FTPLEWYLFG | | EDPDICLEKL | | KHSGAFQLCG |
RVFKSGETTY | | SCRDCAIDPT | | CVLCMDCFQD | | SVHKNHRYKM | | HTSTGGGFCD |
CGDTEAWKTG | | PFCVNHEPGR | | AGTIKENSRC | | PLNEEVIVQA | | RKIFPSVIKY |
VVEMTIWEEE | | KELPPELQIR | | EKNERYYCVL | | FNDEHHSYDH | | VIYSLQRALD |
CELAEAQLHT | | TAIDKEGRRA | | VKAGAYAACQ | | EAKEDIKSHS | | ENVSQHPLHV |
EVLHSEIMAH | | QKFALRLGSW | | MNKIMSYSSD | | FRQIFCQACL | | REEPDSENPC |
LISRLMLWDA | | KLYKGARKIL | | HELIFSSFFM | | EMEYKKLFAM | | EFVKYYKQLQ |
KEYISDDHDR | | SISITALSVQ | | MFTVPTLARH | | LIEEQNVISV | | ITETLLEVLP |
EYLDRNNKFN | | FQGYSQDKLG | | RVYAVICDLK | | YILISKPTIW | | TERLRMQFLE |
GFRSFLKILT | | CMQGMEEIRR | | QVGQHIEVDP | | DWEAAIAIQM | | QLKNILLMFQ |
EWCACDEELL | | LVAYKECHKA | | VMRCSTSFIS | | SSKTVVQSCG | | HSLETKSYRV |
SEDLVSIHLP | | LSRTLAGLHV | | RLSRLGAVSR | | LHEFVSFEDF | | QVEVLVEYPL |
RCLVLVAQVV | | AEMWRRNGLS | | LISQVFYYQD | | VKCREEMYDK | | DIIMLQIGAS |
LMDPNKFLLL | | VLQRYELAEA | | FNKTISTKDQ | | DLIKQYNTLI | | EEMLQVLIYI |
VGERYVPGVG | | NVTKEEVTMR | | EIIHLLCIEP | | MPHSAIAKNL | | PENENNETGL |
ENVINKVATF | | KKPGVSGHGV | | YELKDESLKD | | FNMYFYHYSK | | TQHSKAEHMQ |
KKRRKQENKD | | EALPPPPPPE | | FCPAFSKVIN | | LLNCDIMMYI | | LRTVFERAID |
TDSNLWTEGM | | LQMAFHILAL | | GLLEEKQQLQ | | KAPEEEVTFD | | FYHKASRLGS |
SAMNIQMLLE | | KLKGIPQLEG | | QKDMITWILQ | | MFDTVKRLRE | | KSCLIVATTS |
GSESIKNDEI | | THDKEKAERK | | RKAEAARLHR | | QKIMAQMSAL | | QKNFIETHKL |
MYDNTSEMPG | | KEDSIMEEES | | TPAVSDYSRI | | ALGPKRGPSV | | TEKEVLTCIL |
CQEEQEVKIE | | NNAMVLSACV | | QKSTALTQHR | | GKPIELSGEA | | LDPLFMDPDL |
AYGTYTGSCG | | HVMHAVCWQK | | YFEAVQLSSQ | | QRIHVDLFDL | | ESGEYLCPLC |
KSLCNTVIPI | | IPLQPQKINS | | ENADALAQLL | | TLARWIQTVL | | ARISGYNIRH |
AKGENPIPIF | | FNQGMGDSTL | | EFHSILSFGV | | ESSIKYSNSI | | KEMVILFATT |
IYRIGLKVPP | | DERDPRVPML | | TWSTCAFTIQ | | AIENLLGDEG | | KPLFGALQNR |
QHNGLKALMQ | | FAVAQRITCP | | QVLIQKHLVR | | LLSVVLPNIK | | SEDTPCLLSI |
DLFHVLVGAV | | LAFPSLYWDD | | PVDLQPSSVS | | SSYNHLYLFH | | LITMAHMLQI |
LLTVDTGLPL | | AQVQEDSEEA | | HSASSFFAEI | | SQYTSGSIGC | | DIPGWYLWVS |
LKNGITPYLR | | CAALFFHYLL | | GVTPPEELHT | | NSAEGEYSAL | | CSYLSLPTNL |
FLLFQEYWDT | | VRPLLQRWCA | | DPALLNCLKQ | | KNTVVRYPRK | | RNSLIELPDD |
YSCLLNQASH | | FRCPRSADDE | | RKHPVLCLFC | | GAILCSQNIC | | CQEIVNGEEV |
GACIFHALHC | | GAGVCIFLKI | | RECRVVLVEG | | KARGCAYPAP | | YLDEYGETDP |
GLKRGNPLHL | | SRERYRKLHL | | VWQQHCIIEE | | IARSQETNQM | | LFGFNWQLL |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Yin J., Kwon Y.T., Varshavsky A., Wang W. (2004). RECQL4, mutated in the Rothmund-Thomson and RAPADILINO syndromes, interacts with ubiquitin ligases UBR1 and UBR2 of the N-end rule pathway. Hum. Mol. Genet. 13: 2421—2430. PMID 15317757 DOI:10.1093/hmg/ddh269
- Matta-Camacho E., Kozlov G., Li F.F., Gehring K. (2010). Structural basis of substrate recognition and specificity in the N-end rule pathway. Nat. Struct. Mol. Biol. 17: 1182—1187. PMID 20835242 DOI:10.1038/nsmb.1894
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16808 (англ.) . Архів оригіналу за 30 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8IWV7 (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |