UBA6

Ідентифікатори

Символи

UBA6, E1-L2, MOP-4, UBE1L2, ubiquitin like modifier activating enzyme 6

Зовнішні ІД

OMIM: 611361 MGI: 1913894 HomoloGene: 10080 GeneCards: UBA6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• FAT10 activating enzyme activity • nucleotide binding • ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • ubiquitin-like modifier activating enzyme activity • ubiquitin activating enzyme activity
Клітинна компонента	• гіалоплазма • цитоплазма
Біологічний процес	• dendritic spine development • amygdala development • навчення • hippocampus development • ubiquitin-dependent protein catabolic process • locomotory behavior • Убіквітин-залежний протеоліз • cellular response to DNA damage stimulus • protein modification by small protein conjugation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55236


231380

Ensembl


ENSG00000033178


ENSMUSG00000035898

UniProt


A0AVT1 H0Y9U5


Q8C7R4

RefSeq (мРНК)


NM_018227


NM_172712

RefSeq (білок)


NP_060697


NP_766300

Локус (UCSC)

Хр. 4: 67.61 – 67.7 Mb

Хр. 5: 86.26 – 86.32 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

UBA6 (англ. Ubiquitin like modifier activating enzyme 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 052 амінокислот, а молекулярна маса — 117 970^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEGSEPVAAH	QGEEASCSSW	GTGSTNKNLP	IMSTASVEID	DALYSRQRYV
LGDTAMQKMA	KSHVFLSGMG	GLGLEIAKNL	VLAGIKAVTI	HDTEKCQAWD
LGTNFFLSED	DVVNKRNRAE	AVLKHIAELN	PYVHVTSSSV	PFNETTDLSF
LDKYQCVVLT	EMKLPLQKKI	NDFCRSQCPP	IKFISADVHG	IWSRLFCDFG
DEFEVLDTTG	EEPKEIFISN	ITQANPGIVT	CLENHPHKLE	TGQFLTFREI
NGMTGLNGSI	QQITVISPFS	FSIGDTTELE	PYLHGGIAVQ	VKTPKTVFFE
SLERQLKHPK	CLIVDFSNPE	APLEIHTAML	ALDQFQEKYS	RKPNVGCQQD
SEELLKLATS	ISETLEEKPD	VNADIVHWLS	WTAQGFLSPL	AAAVGGVASQ
EVLKAVTGKF	SPLCQWLYLE	AADIVESLGK	PECEEFLPRG	DRYDALRACI
GDTLCQKLQN	LNIFLVGCGA	IGCEMLKNFA	LLGVGTSKEK	GMITVTDPDL
IEKSNLNRQF	LFRPHHIQKP	KSYTAADATL	KINSQIKIDA	HLNKVCPTTE
TIYNDEFYTK	QDVIITALDN	VEARRYVDSR	CLANLRPLLD	SGTMGTKGHT
EVIVPHLTES	YNSHRDPPEE	EIPFCTLKSF	PAAIEHTIQW	ARDKFESSFS
HKPSLFNKFW	QTYSSAEEVL	QKIQSGHSLE	GCFQVIKLLS	RRPRNWSQCV
ELARLKFEKY	FNHKALQLLH	CFPLDIRLKD	GSLFWQSPKR	PPSPIKFDLN
EPLHLSFLQN	AAKLYATVYC	IPFAEEDLSA	DALLNILSEV	KIQEFKPSNK
VVQTDETARK	PDHVPISSED	ERNAIFQLEK	AILSNEATKS	DLQMAVLSFE
KDDDHNGHID	FITAASNLRA	KMYSIEPADR	FKTKRIAGKI	IPAIATTTAT
VSGLVALEMI	KVTGGYPFEA	YKNCFLNLAI	PIVVFTETTE	VRKTKIRNGI
SFTIWDRWTV	HGKEDFTLLD	FINAVKEKYG	IEPTMVVQGV	KMLYVPVMPG
HAKRLKLTMH	KLVKPTTEKK	YVDLTVSFAP	DIDGDEDLPG	PPVRYYFSHD
TD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами.

Література

Jin J., Li X., Gygi S.P., Harper J.W. (2007). Dual E1 activation systems for ubiquitin differentially regulate E2 enzyme charging. Nature. 447: 1135—1138. PMID 17597759 DOI:10.1038/nature05902
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chiu Y.-H., Sun Q., Chen Z.J. (2007). E1-L2 activates both ubiquitin and FAT10. Mol. Cell. 27: 1014—1023. PMID 17889673 DOI:10.1016/j.molcel.2007.08.020

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25581 (англ.) . Архів оригіналу за 12 березня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, A0AVT1 (англ.) . Архів оригіналу за 15 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.