TRIM37 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRIM37, MUL, POB1, TEF3, tripartite motif containing 37 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605073 MGI: 2153072 HomoloGene: 9084 GeneCards: TRIM37 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
mulibrey nanism[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein homodimerization activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • zinc ion binding • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • tumor necrosis factor receptor binding • ubiquitin protein ligase binding • transferase activity |
---|
Клітинна компонента | • гіалоплазма • ESC/E(Z) complex • внутрішньоклітинний • aggresome • perinuclear region of cytoplasm • пероксисома • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of centriole replication • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • Убіквітин-залежний протеоліз • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • aggresome assembly • protein autoubiquitination • histone H2A monoubiquitination • histone H2A-K119 monoubiquitination |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001005207 NM_015294 NM_001320987 NM_001320988 NM_001320989
| NM_001320990 NM_001353082 NM_001353083 NM_001353084 NM_001353085 NM_001353086 |
| | NM_197987 NM_001363025 NM_001363026 NM_001363027 NM_001363028 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001005207 NP_001307916 NP_001307917 NP_001307918 NP_001307919
| NP_056109 NP_001340011 NP_001340012 NP_001340013 NP_001340014 NP_001340015 |
| | NP_932104 NP_001349954 NP_001349955 NP_001349956 NP_001349957 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 58.98 – 59.11 Mb | Хр. 11: 87.02 – 87.11 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRIM37 (англ. Tripartite motif containing 37) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 964 амінокислот, а молекулярна маса — 107 906[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDEQSVESIA | | EVFRCFICME | | KLRDARLCPH | | CSKLCCFSCI | | RRWLTEQRAQ |
CPHCRAPLQL | | RELVNCRWAE | | EVTQQLDTLQ | | LCSLTKHEEN | | EKDKCENHHE |
KLSVFCWTCK | | KCICHQCALW | | GGMHGGHTFK | | PLAEIYEQHV | | TKVNEEVAKL |
RRRLMELISL | | VQEVERNVEA | | VRNAKDERVR | | EIRNAVEMMI | | ARLDTQLKNK |
LITLMGQKTS | | LTQETELLES | | LLQEVEHQLR | | SCSKSELISK | | SSEILMMFQQ |
VHRKPMASFV | | TTPVPPDFTS | | ELVPSYDSAT | | FVLENFSTLR | | QRADPVYSPP |
LQVSGLCWRL | | KVYPDGNGVV | | RGYYLSVFLE | | LSAGLPETSK | | YEYRVEMVHQ |
SCNDPTKNII | | REFASDFEVG | | ECWGYNRFFR | | LDLLANEGYL | | NPQNDTVILR |
FQVRSPTFFQ | | KSRDQHWYIT | | QLEAAQTSYI | | QQINNLKERL | | TIELSRTQKS |
RDLSPPDNHL | | SPQNDDALET | | RAKKSACSDM | | LLEGGPTTAS | | VREAKEDEED |
EEKIQNEDYH | | HELSDGDLDL | | DLVYEDEVNQ | | LDGSSSSASS | | TATSNTEEND |
IDEETMSGEN | | DVEYNNMELE | | EGELMEDAAA | | AGPAGSSHGY | | VGSSSRISRR |
THLCSAATSS | | LLDIDPLILI | | HLLDLKDRSS | | IENLWGLQPR | | PPASLLQPTA |
SYSRKDKDQR | | KQQAMWRVPS | | DLKMLKRLKT | | QMAEVRCMKT | | DVKNTLSEIK |
SSSAASGDMQ | | TSLFSADQAA | | LAACGTENSG | | RLQDLGMELL | | AKSSVANCYI |
RNSTNKKSNS | | PKPARSSVAG | | SLSLRRAVDP | | GENSRSKGDC | | QTLSEGSPGS |
SQSGSRHSSP | | RALIHGSIGD | | ILPKTEDRQC | | KALDSDAVVV | | AVFSGLPAVE |
KRRKMVTLGA | | NAKGGHLEGL | | QMTDLENNSE | | TGELQPVLPE | | GASAAPEEGM |
SSDSDIECDT | | ENEEQEEHTS | | VGGFHDSFMV | | MTQPPDEDTH | | SSFPDGEQIG |
PEDLSFNTDE | | NSGR |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, пероксисомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kallijarvi J., Avela K., Lipsanen-Nyman M., Ulmanen I., Lehesjoki A.E. (2002). The TRIM37 gene encodes a peroxisomal RING-B-box-coiled-coil protein: classification of mulibrey nanism as a new peroxisomal disorder. Am. J. Hum. Genet. 70: 1215—1228. PMID 11938494 DOI:10.1086/340256
- Hamalainen R.H., Joensuu T., Kallijarvi J., Lehesjoki A.E. (2006). Characterisation of the mulibrey nanism-associated TRIM37 gene: transcription initiation, promoter region and alternative splicing. Gene. 366: 180—188. PMID 16310976 DOI:10.1016/j.gene.2005.08.008
- Balestra F.R., Strnad P., Fluckiger I., Gonczy P. (2013). Discovering regulators of centriole biogenesis through siRNA-based functional genomics in human cells. Dev. Cell. 25: 555—571. PMID 23769972 DOI:10.1016/j.devcel.2013.05.016
- Kumpf M., Hamalainen R.H., Hofbeck M., Baden W. (2013). Refractory congestive heart failure following delayed pericardectomy in a 12-year-old child with Mulibrey nanism due to a novel mutation in TRIM37. Eur. J. Pediatr. 172: 1415—1418. PMID 23385855 DOI:10.1007/s00431-013-1962-2
- Tabah A.A., Tardif K., Mansky L.M. (2014). Anti-HIV-1 activity of Trim 37. J. Gen. Virol. 95: 960—967. PMID 24317724 DOI:10.1099/vir.0.057653-0
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TRIM37 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7523 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O94972 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |