TRIM3 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRIM3, BERP, HAC1, RNF22, RNF97, tripartite motif containing 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605493 MGI: 1860040 HomoloGene: 21290 GeneCards: TRIM3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • zinc ion binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • ендосома • early endosome • внутрішньоклітинний • комплекс Ґольджі • дендрит (нейробіологія) • cell projection |
---|
Біологічний процес | • protein transport • Убіквітин-залежний протеоліз • нейробіологія розвитку • protein polyubiquitination • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001248006 NM_001248007 NM_006458 NM_033278 NM_033279 |
| | NM_001285870 NM_001285871 NM_001285873 NM_018880 NM_001360425 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001234935 NP_001234936 NP_006449 NP_150594 |
| | NP_001272799 NP_001272800 NP_001272802 NP_061368 NP_001347354 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 6.45 – 6.47 Mb | Хр. 7: 105.25 – 105.28 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRIM3 (англ. Tripartite motif containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 744 амінокислот, а молекулярна маса — 80 830[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAKREDSPGP | | EVQPMDKQFL | | VCSICLDRYQ | | CPKVLPCLHT | | FCERCLQNYI |
PAQSLTLSCP | | VCRQTSILPE | | QGVSALQNNF | | FISSLMEAMQ | | QAPDGAHDPE |
DPHPLSVVAG | | RPLSCPNHEG | | KTMEFYCEAC | | ETAMCGECRA | | GEHREHGTVL |
LRDVVEQHKA | | ALQRQLEAVR | | GRLPQLSAAI | | ALVGGISQQL | | QERKAEALAQ |
ISAAFEDLEQ | | ALQQRKQALV | | SDLETICGAK | | QKVLQSQLDT | | LRQGQEHIGS |
SCSFAEQALR | | LGSAPEVLLV | | RKHMRERLAA | | LAAQAFPERP | | HENAQLELVL |
EVDGLRRSVL | | NLGALLTTSA | | TAHETVATGE | | GLRQALVGQP | | ASLTVTTKDK |
DGRLVRTGSA | | ELRAEITGPD | | GTRLPVPVVD | | HKNGTYELVY | | TARTEGELLL |
SVLLYGQPVR | | GSPFRVRALR | | PGDLPPSPDD | | VKRRVKSPGG | | PGSHVRQKAV |
RRPSSMYSTG | | GKRKDNPIED | | ELVFRVGSRG | | REKGEFTNLQ | | GVSAASSGRI |
VVADSNNQCI | | QVFSNEGQFK | | FRFGVRGRSP | | GQLQRPTGVA | | VDTNGDIIVA |
DYDNRWVSIF | | SPEGKFKTKI | | GAGRLMGPKG | | VAVDRNGHII | | VVDNKSCCVF |
TFQPNGKLVG | | RFGGRGATDR | | HFAGPHFVAV | | NNKNEIVVTD | | FHNHSVKVYS |
ADGEFLFKFG | | SHGEGNGQFN | | APTGVAVDSN | | GNIIVADWGN | | SRIQVFDSSG |
SFLSYINTSA | | EPLYGPQGLA | | LTSDGHVVVA | | DAGNHCFKAY | | RYLQ |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, клітинних відростках, апараті гольджі, ендосомах.
Література
- El-Husseini A.E.-D., Fretier P., Vincent S.R. (2001). Cloning and characterization of a gene (RNF22) encoding a novel brain expressed ring finger protein (BERP) that maps to human chromosome 11p15.5. Genomics. 71: 363—367. PMID 11170753 DOI:10.1006/geno.2000.6452
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10064 (англ.) . Архів оригіналу за 12 червня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O75382 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |