TRIM25

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4CFG, 4LTB, 5FER

Ідентифікатори

Символи

TRIM25, EFP, RNF147, Z147, ZNF147, tripartite motif containing 25

Зовнішні ІД

OMIM: 600453 MGI: 102749 HomoloGene: 48325 GeneCards: TRIM25

шифр КФ

2.3.2.27

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • зв'язування з іоном металу • ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • RNA binding • cadherin binding • zinc ion binding
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма • ядерні тільця • внутрішньоклітинний
Біологічний процес	• ERAD pathway • negative regulation of viral entry into host cell • процес імунної системи • interferon-gamma-mediated signaling pathway • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • protein monoubiquitination • defense response to virus • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • translesion synthesis • negative regulation of type I interferon production • вроджений імунітет • GO:0022415 viral process • response to estrogen • response to vitamin D • protein deubiquitination • ubiquitin-dependent ERAD pathway • cellular response to leukemia inhibitory factor • ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of viral entry into host cell
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7706


217069

Ensembl


ENSG00000121060


ENSMUSG00000000275

UniProt


Q14258


Q61510

RefSeq (мРНК)


NM_005082


NM_009546

RefSeq (білок)


NP_005073


NP_033572

Локус (UCSC)

Хр. 17: 56.84 – 56.91 Mb

Хр. 11: 88.89 – 88.91 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRIM25 (англ. Tripartite motif containing 25) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 630 амінокислот, а молекулярна маса — 70 973^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAELCPLAEE	LSCSICLEPF	KEPVTTPCGH	NFCGSCLNET	WAVQGSPYLC
PQCRAVYQAR	PQLHKNTVLC	NVVEQFLQAD	LAREPPADVW	TPPARASAPS
PNAQVACDHC	LKEAAVKTCL	VCMASFCQEH	LQPHFDSPAF	QDHPLQPPVR
DLLRRKCSQH	NRLREFFCPE	HSECICHICL	VEHKTCSPAS	LSQASADLEA
TLRHKLTVMY	SQINGASRAL	DDVRNRQQDV	RMTANRKVEQ	LQQEYTEMKA
LLDASETTST	RKIKEEEKRV	NSKFDTIYQI	LLKKKSEIQT	LKEEIEQSLT
KRDEFEFLEK	ASKLRGISTK	PVYIPEVELN	HKLIKGIHQS	TIDLKNELKQ
CIGRLQEPTP	SSGDPGEHDP	ASTHKSTRPV	KKVSKEEKKS	KKPPPVPALP
SKLPTFGAPE	QLVDLKQAGL	EAAAKATSSH	PNSTSLKAKV	LETFLAKSRP
ELLEYYIKVI	LDYNTAHNKV	ALSECYTVAS	VAEMPQNYRP	HPQRFTYCSQ
VLGLHCYKKG	IHYWEVELQK	NNFCGVGICY	GSMNRQGPES	RLGRNSASWC
VEWFNTKISA	WHNNVEKTLP	STKATRVGVL	LNCDHGFVIF	FAVADKVHLM
YKFRVDFTEA	LYPAFWVFSA	GATLSICSPK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, лігаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, противірусний захист, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zou W., Zhang D.-E. (2006). The interferon-inducible ubiquitin-protein isopeptide ligase (E3) EFP also functions as an ISG15 E3 ligase. J. Biol. Chem. 281: 3989—3994. PMID 16352599 DOI:10.1074/jbc.M510787200
Zou W., Wang J., Zhang D.-E. (2007). Negative regulation of ISG15 E3 ligase EFP through its autoISGylation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 354: 321—327. PMID 17222803 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.12.210

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12932 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q14258 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.