TRIM23 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRIM23, ARD1, ARFD1, RNF46, tripartite motif containing 23 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601747 MGI: 1933161 HomoloGene: 1251 GeneCards: TRIM23 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0010577 enzyme activator activity • identical protein binding • GO:0006184 GTPase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GDP binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • nucleotide binding • GTP binding • transferase activity • nucleic acid binding |
---|
Клітинна компонента | • система ендомембран • Golgi membrane • клітинне ядро • lysosomal membrane • внутрішньоклітинний • мембрана • лізосома • цитоплазма • комплекс Ґольджі • клітинна мембрана |
---|
Біологічний процес | • Убіквітин-залежний протеоліз • GO:0022415 viral process • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity • процес імунної системи • вроджений імунітет • intracellular protein transport • Golgi to plasma membrane transport • vesicle-mediated transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001656 NM_033227 NM_033228 |
| | NM_030731 NM_001361538 NM_001361539 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001647 NP_150230 NP_150231 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 65.59 – 65.63 Mb | Хр. 13: 104.32 – 104.34 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRIM23 (англ. Tripartite motif containing 23) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 574 амінокислот, а молекулярна маса — 64 067[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MATLVVNKLG | | AGVDSGRQGS | | RGTAVVKVLE | | CGVCEDVFSL | | QGDKVPRLLL |
CGHTVCHDCL | | TRLPLHGRAI | | RCPFDRQVTD | | LGDSGVWGLK | | KNFALLELLE |
RLQNGPIGQY | | GAAEESIGIS | | GESIIRCDED | | EAHLASVYCT | | VCATHLCSEC |
SQVTHSTKTL | | AKHRRVPLAD | | KPHEKTMCSQ | | HQVHAIEFVC | | LEEGCQTSPL |
MCCVCKEYGK | | HQGHKHSVLE | | PEANQIRASI | | LDMAHCIRTF | | TEEISDYSRK |
LVGIVQHIEG | | GEQIVEDGIG | | MAHTEHVPGT | | AENARSCIRA | | YFYDLHETLC |
RQEEMALSVV | | DAHVREKLIW | | LRQQQEDMTI | | LLSEVSAACL | | HCEKTLQQDD |
CRVVLAKQEI | | TRLLETLQKQ | | QQQFTEVADH | | IQLDASIPVT | | FTKDNRVHIG |
PKMEIRVVTL | | GLDGAGKTTI | | LFKLKQDEFM | | QPIPTIGFNV | | ETVEYKNLKF |
TIWDVGGKHK | | LRPLWKHYYL | | NTQAVVFVVD | | SSHRDRISEA | | HSELAKLLTE |
KELRDALLLI | | FANKQDVAGA | | LSVEEITELL | | SLHKLCCGRS | | WYIQGCDARS |
GMGLYEGLDW | | LSRQLVAAGV | | LDVA |
Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, ГТФ. Локалізований у мембрані, лізосомі, апараті гольджі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Vitale N., Horiba K., Ferrans V.J., Moss J., Vaughan M. (1998). Localization of ADP-ribosylation factor domain protein 1 (ARD1) in lysosomes and Golgi apparatus. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 8613—8618. PMID 9671726 DOI:10.1073/pnas.95.15.8613
- Vichi A., Payne D.M., Pacheco-Rodriguez G., Moss J., Vaughan M. (2005). E3 ubiquitin ligase activity of the trifunctional ARD1 (ADP-ribosylation factor domain protein 1). Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 1945—1950. PMID 15684077 DOI:10.1073/pnas.0409800102
- Mishima K., Tsuchiya M., Nightingale M.S., Moss J., Vaughan M. (1993). ARD 1, a 64-kDa guanine nucleotide-binding protein with a carboxyl-terminal ADP-ribosylation factor domain. J. Biol. Chem. 268: 8801—8807. PMID 8473324
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:660 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P36406 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |