TRIM15 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

TRIM15

Ідентифікатори

Символи

TRIM15, RNF93, ZNF178, ZNFB7, tripartite motif containing 15

Зовнішні ІД

MGI: 1916347 HomoloGene: 23819 GeneCards: TRIM15

Онтологія гена
Молекулярна функція	• zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинний
Біологічний процес	• mesodermal cell fate determination • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • вроджений імунітет • positive regulation of RIG-I signaling pathway • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of type I interferon production • negative regulation of intracellular transport of viral material
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


89870


69097

Ensembl

ENSG00000235960 ENSG00000227147 ENSG00000233599 ENSG00000204610 ENSG00000224145
ENSG00000235905 ENSG00000137384 ENSG00000235259


ENSMUSG00000050747

UniProt


Q9C019


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_033229 NM_052812


NM_001024134 NM_001177872

RefSeq (білок)


NP_150232


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 6: 30.16 – 30.17 Mb

Хр. 17: 37.17 – 37.18 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRIM15 (англ. Tripartite motif containing 15) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 465 амінокислот, а молекулярна маса — 52 113^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPATPSLKVV	HELPACTLCA	GPLEDAVTIP	CGHTFCRLCL	PALSQMGAQS
SGKILLCPLC	QEEEQAETPM	APVPLGPLGE	TYCEEHGEKI	YFFCENDAEF
LCVFCREGPT	HQAHTVGFLD	EAIQPYRDRL	RSRLEALSTE	RDEIEDVKCQ
EDQKLQVLLT	QIESKKHQVE	TAFERLQQEL	EQQRCLLLAR	LRELEQQIWK
ERDEYITKVS	EEVTRLGAQV	KELEEKCQQP	ASELLQDVRV	NQSRCEMKTF
VSPEAISPDL	VKKIRDFHRK	ILTLPEMMRM	FSENLAHHLE	IDSGVITLDP
QTASRSLVLS	EDRKSVRYTR	QKKSLPDSPL	RFDGLPAVLG	FPGFSSGRHR
WQVDLQLGDG	GGCTVGVAGE	GVRRKGEMGL	SAEDGVWAVI	ISHQQCWAST
SPGTDLPLSE	IPRGVRVALD	YEAGQVTLHN	AQTQEPIFTF	TASFSGKVFP
FFAVWKKGSC	LTLKG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Goei V.L., Parimoo S., Capossela A., Chu T.W., Gruen J.R. (1994). Isolation of novel non-HLA gene fragments from the hemochromatosis region (6p21.3) by cDNA hybridization selection. Am. J. Hum. Genet. 54: 244—251. PMID 8304341

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16284 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9C019 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.