TRIM11

Ідентифікатори

Символи

TRIM11, BIA1, RNF92, tripartite motif containing 11

Зовнішні ІД

OMIM: 607868 MGI: 2137355 HomoloGene: 14225 GeneCards: TRIM11

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • zinc ion binding • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein domain specific binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • зв'язування з іоном металу • transferase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • внутрішньоклітинний • клітинне ядро • гіалоплазма
Біологічний процес	• negative regulation of neurogenesis • вроджений імунітет • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • defense response to virus • Убіквітин-залежний протеоліз • negative regulation of viral transcription • negative regulation of viral entry into host cell • positive regulation of viral entry into host cell
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


81559


94091

Ensembl


ENSG00000154370


ENSMUSG00000020455

UniProt


Q96F44


Q99PQ2

RefSeq (мРНК)


NM_145214


NM_001290988 NM_053168

RefSeq (білок)


NP_660215


NP_001277917 NP_444398

Локус (UCSC)

Хр. 1: 228.39 – 228.41 Mb

Хр. 11: 58.87 – 58.88 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRIM11 (англ. Tripartite motif containing 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 468 амінокислот, а молекулярна маса — 52 774^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAPDLSTNL	QEEATCAICL	DYFTDPVMTD	CGHNFCRECI	RRCWGQPEGP
YACPECRELS	PQRNLRPNRP	LAKMAEMARR	LHPPSPVPQG	VCPAHREPLA
AFCGDELRLL	CAACERSGEH	WAHRVRPLQD	AAEDLKAKLE	KSLEHLRKQM
QDALLFQAQA	DETCVLWQKM	VESQRQNVLG	EFERLRRLLA	EEEQQLLQRL
EEEELEVLPR	LREGAAHLGQ	QSAHLAELIA	ELEGRCQLPA	LGLLQDIKDA
LRRVQDVKLQ	PPEVVPMELR	TVCRVPGLVE	TLRRFRGDVT	LDPDTANPEL
ILSEDRRSVQ	RGDLRQALPD	SPERFDPGPC	VLGQERFTSG	RHYWEVEVGD
RTSWALGVCR	ENVNRKEKGE	LSAGNGFWIL	VFLGSYYNSS	ERALAPLRDP
PRRVGIFLDY	EAGHLSFYSA	TDGSLLFIFP	EIPFSGTLRP	LFSPLSSSPT
PMTICRPKGG	SGDTLAPQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, антивірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ishikawa H., Tachikawa H., Miura Y., Takahashi N. (2006). TRIM11 binds to and destabilizes a key component of the activator-mediated cofactor complex (ARC105) through the ubiquitin-proteasome system. FEBS Lett. 580: 4784—4792. PMID 16904669 DOI:10.1016/j.febslet.2006.07.066
Uchil P.D., Quinlan B.D., Chan W.T., Luna J.M., Mothes W. (2008). TRIM E3 ligases interfere with early and late stages of the retroviral life cycle. PLoS Pathog. 4: E16—E16. PMID 18248090 DOI:10.1371/journal.ppat.0040016

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16281 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q96F44 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.