TRAF4 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2EOD, 2YUC, 3ZJB, 4K8U, 4M4E | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRAF4, CART1, MLN62, RNF83, TNF receptor associated factor 4 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602464 MGI: 1202880 HomoloGene: 3173 GeneCards: TRAF4 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • WW domain binding • thioesterase binding • tumor necrosis factor receptor binding • protein kinase binding • ubiquitin protein ligase binding • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • мембрана • bicellular tight junction • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • perinuclear region of cytoplasm • цитоскелет • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex • внутрішньоклітинний |
---|
Біологічний процес | • regulation of apoptotic process • activation of NF-kappaB-inducing kinase activity • positive regulation of JNK cascade • positive regulation of protein homodimerization activity • respiratory gaseous exchange by respiratory system • multicellular organism development • respiratory tube development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of protein kinase activity • GO:0097285 апоптоз |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 28.74 – 28.75 Mb | Хр. 11: 78.05 – 78.06 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRAF4 (англ. TNF receptor associated factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 470 амінокислот, а молекулярна маса — 53 543[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPGFDYKFLE | | KPKRRLLCPL | | CGKPMREPVQ | | VSTCGHRFCD | | TCLQEFLSEG |
VFKCPEDQLP | | LDYAKIYPDP | | ELEVQVLGLP | | IRCIHSEEGC | | RWSGPLRHLQ |
GHLNTCSFNV | | IPCPNRCPMK | | LSRRDLPAHL | | QHDCPKRRLK | | CEFCGCDFSG |
EAYESHEGMC | | PQESVYCENK | | CGARMMRRLL | | AQHATSECPK | | RTQPCTYCTK |
EFVFDTIQSH | | QYQCPRLPVA | | CPNQCGVGTV | | AREDLPGHLK | | DSCNTALVLC |
PFKDSGCKHR | | CPKLAMARHV | | EESVKPHLAM | | MCALVSRQRQ | | ELQELRRELE |
ELSVGSDGVL | | IWKIGSYGRR | | LQEAKAKPNL | | ECFSPAFYTH | | KYGYKLQVSA |
FLNGNGSGEG | | THLSLYIRVL | | PGAFDNLLEW | | PFARRVTFSL | | LDQSDPGLAK |
PQHVTETFHP | | DPNWKNFQKP | | GTWRGSLDES | | SLGFGYPKFI | | SHQDIRKRNY |
VRDDAVFIRA | | AVELPRKILS |
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Fleckenstein D.S., Dirks W.G., Drexler H.G., Quentmeier H. (2003). Tumor necrosis factor receptor-associated factor (TRAF) 4 is a new binding partner for the p70S6 serine/threonine kinase. Leuk. Res. 27: 687—694. PMID 12801526 DOI:10.1016/S0145-2126(02)00325-9
- Abell A.N., Johnson G.L. (2005). MEKK4 is an effector of the embryonic TRAF4 for JNK activation. J. Biol. Chem. 280: 35793—35796. PMID 16157600 DOI:10.1074/jbc.C500260200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12034 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9BUZ4 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |