TNPO3 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4C0O, 4C0P, 4C0Q, 4OL0 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TNPO3, IPO12, LGMD1F, MTR10A, TRN-SR, TRN-SR2, TRNSR, transportin 3, LGMDD2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610032 MGI: 1196412 HomoloGene: 40848 GeneCards: TNPO3 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
системний червоний вовчак, autosomal dominant limb-girdle muscular dystrophy type 1F[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nuclear localization sequence binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • signaling receptor activity • nuclear import signal receptor activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • ядерна мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • protein transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • protein import into nucleus • GO:0015915 транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_177296 NM_001347079 NM_001361290 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001177957 NP_036602 NP_001369145 NP_001369146 NP_001369147
| NP_001369148 NP_001369149 NP_001369150 NP_001369151 NP_001369152 NP_036602.1 |
| | NP_001334008 NP_796270 NP_001348219 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 128.95 – 129.06 Mb | Хр. 6: 29.54 – 29.61 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TNPO3 (англ. Transportin 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 923 амінокислот, а молекулярна маса — 104 203[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEGAKPTLQL | | VYQAVQALYH | | DPDPSGKERA | | SFWLGELQRS | | VHAWEISDQL |
LQIRQDVESC | | YFAAQTMKMK | | IQTSFYELPT | | DSHASLRDSL | | LTHIQNLKDL |
SPVIVTQLAL | | AIADLALQMP | | SWKGCVQTLV | | EKYSNDVTSL | | PFLLEILTVL |
PEEVHSRSLR | | IGANRRTEII | | EDLAFYSSTV | | VSLLMTCVEK | | AGTDEKMLMK |
VFRCLGSWFN | | LGVLDSNFMA | | NNKLLALLFE | | VLQQDKTSSN | | LHEAASDCVC |
SALYAIENVE | | TNLPLAMQLF | | QGVLTLETAY | | HMAVAREDLD | | KVLNYCRIFT |
ELCETFLEKI | | VCTPGQGLGD | | LRTLELLLIC | | AGHPQYEVVE | | ISFNFWYRLG |
EHLYKTNDEV | | IHGIFKAYIQ | | RLLHALARHC | | QLEPDHEGVP | | EETDDFGEFR |
MRVSDLVKDL | | IFLIGSMECF | | AQLYSTLKEG | | NPPWEVTEAV | | LFIMAAIAKS |
VDPENNPTLV | | EVLEGVVRLP | | ETVHTAVRYT | | SIELVGEMSE | | VVDRNPQFLD |
PVLGYLMKGL | | CEKPLASAAA | | KAIHNICSVC | | RDHMAQHFNG | | LLEIARSLDS |
FLLSPEAAVG | | LLKGTALVLA | | RLPLDKITEC | | LSELCSVQVM | | ALKKLLSQEP |
SNGISSDPTV | | FLDRLAVIFR | | HTNPIVENGQ | | THPCQKVIQE | | IWPVLSETLN |
KHRADNRIVE | | RCCRCLRFAV | | RCVGKGSAAL | | LQPLVTQMVN | | VYHVHQHSCF |
LYLGSILVDE | | YGMEEGCRQG | | LLDMLQALCI | | PTFQLLEQQN | | GLQNHPDTVD |
DLFRLATRFI | | QRSPVTLLRS | | QVVIPILQWA | | IASTTLDHRD | | ANCSVMRFLR |
DLIHTGVAND | | HEEDFELRKE | | LIGQVMNQLG | | QQLVSQLLHT | | CCFCLPPYTL |
PDVAEVLWEI | | MQVDRPTFCR | | WLENSLKGLP | | KETTVGAVTV | | THKQLTDFHK |
QVTSAEECKQ | | VCWALRDFTR | | LFR |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Kataoka N., Bachorik J.L., Dreyfuss G. (1999). Transportin-SR, a nuclear import receptor for SR proteins. J. Cell Biol. 145: 1145—1152. PMID 10366588 DOI:10.1083/jcb.145.6.1145
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lai M.-C., Lin R.-I., Huang S.-Y., Tsai C.-W., Tarn W.-Y. (2000). A human importin-beta family protein, transportin-SR2, interacts with the phosphorylated RS domain of SR proteins. J. Biol. Chem. 275: 7950—7957. PMID 10713112 DOI:10.1074/jbc.275.11.7950
- Lai M.-C., Lin R.-I., Tarn W.-Y. (2001). Transportin-SR2 mediates nuclear import of phosphorylated SR proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 10154—10159. PMID 11517331 DOI:10.1073/pnas.181354098
- Lai M.-C., Kuo H.-W., Chang W.-C., Tarn W.-Y. (2003). A novel splicing regulator shares a nuclear import pathway with SR proteins. EMBO J. 22: 1359—1369. PMID 12628928 DOI:10.1093/emboj/cdg126
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TNPO3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17103 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9Y5L0 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |