TFAM

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3FGH, 3TMM, 3TQ6, 4NNU, 4NOD

Ідентифікатори

Символи

TFAM, MTTF1, MTTFA, TCF6, TCF6L1, TCF6L2, TCF6L3, transcription factor A, mitochondrial, MTDPS15

Зовнішні ІД

OMIM: 600438 MGI: 107810 HomoloGene: 31139 GeneCards: TFAM

Пов'язані генетичні захворювання

mitochondrial DNA depletion syndrome 15 (hepatocerebral type);^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0070361, GO:0070364, GO:0070363, GO:0070362 mitochondrial promoter sequence-specific DNA binding • heat shock protein binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transcription coactivator binding • DNA binding, bending • RNA binding • sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента	• гіалоплазма • мітохондріальний матрикс • мітохондрія • mitochondrial nucleoid • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• DNA-dependent DNA replication • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of transcription by RNA polymerase I • transcription initiation from mitochondrial promoter • mitochondrion organization • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • mitochondrial respiratory chain complex assembly • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • mitochondrial transcription
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7019


21780

Ensembl


ENSG00000108064


ENSMUSG00000003923

UniProt


Q00059


P40630

RefSeq (мРНК)


NM_001270782 NM_003201 NM_012251


NM_009360

RefSeq (білок)


NP_001257711 NP_003192


NP_033386

Локус (UCSC)

Хр. 10: 58.39 – 58.4 Mb

Хр. 10: 71.06 – 71.07 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TFAM (англ. Transcription factor A, mitochondrial) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 246 амінокислот, а молекулярна маса — 29 097^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAFLRSMWGV	LSALGRSGAE	LCTGCGSRLR	SPFSFVYLPR	WFSSVLASCP
KKPVSSYLRF	SKEQLPIFKA	QNPDAKTTEL	IRRIAQRWRE	LPDSKKKIYQ
DAYRAEWQVY	KEEISRFKEQ	LTPSQIMSLE	KEIMDKHLKR	KAMTKKKELT
LLGKPKRPRS	AYNVYVAERF	QEAKGDSPQE	KLKTVKENWK	NLSDSEKELY
IQHAKEDETR	YHNEMKSWEE	QMIEVGRKDL	LRRTIKKQRK	YGAEEC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у мітохондрії, мітохондріальному нуклеоїді.

Література

Parisi M.A., Clayton D.A. (1991). Similarity of human mitochondrial transcription factor 1 to high mobility group proteins. Science. 252: 965—969. PMID 2035027 DOI:10.1126/science.2035027
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tominaga K., Akiyama S., Kagawa Y., Ohta S. (1992). Upstream region of a genomic gene for human mitochondrial transcription factor 1. Biochim. Biophys. Acta. 1131: 217—219. PMID 1610904 DOI:10.1016/0167-4781(92)90082-B
McCulloch V., Shadel G.S. (2003). Human mitochondrial transcription factor B1 interacts with the C-terminal activation region of h-mtTFA and stimulates transcription independently of its RNA methyltransferase activity. Mol. Cell. Biol. 23: 5816—5824. PMID 12897151 DOI:10.1128/MCB.23.16.5816-5824.2003
Bogenhagen D.F., Rousseau D., Burke S. (2008). The layered structure of human mitochondrial DNA nucleoids. J. Biol. Chem. 283: 3665—3675. PMID 18063578 DOI:10.1074/jbc.M708444200
Kasashima K., Sumitani M., Endo H. (2012). Maintenance of mitochondrial genome distribution by mitochondrial AAA+ protein ClpX. Exp. Cell Res. 318: 2335—2343. PMID 22841477 DOI:10.1016/j.yexcr.2012.07.012

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TFAM переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11741 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q00059 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.