TCF20

Ідентифікатори

Символи

TCF20, AR1, SPBP, TCF-20, transcription factor 20 (AR1), transcription factor 20, DDVIBA

Зовнішні ІД

OMIM: 603107 MGI: 108399 HomoloGene: 4131 GeneCards: TCF20

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • зв'язування з іоном металу • RNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • ядерні тільця • клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6942


21411

Ensembl

ENSG00000283681 ENSG00000281897 ENSG00000262024 ENSG00000282892 ENSG00000283026
ENSG00000280467 ENSG00000100207 ENSG00000276461


ENSMUSG00000041852

UniProt


Q9UGU0


Q9EPQ8

RefSeq (мРНК)


NM_005650 NM_181492 NM_001378418


NM_001114140 NM_013836

RefSeq (білок)


NP_005641 NP_852469 NP_001365347


NP_001107612 NP_038864 NP_001389767

Локус (UCSC)

Хр. 22: 42.16 – 42.34 Mb

Хр. 15: 82.69 – 82.87 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TCF20 (англ. Transcription factor 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 960 амінокислот, а молекулярна маса — 211 771^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQSFREQSSY	HGNQQSYPQE	VHGSSRLEEF	SPRQAQMFQN	FGGTGGSSGS
SGSGSGGGRR	GAAAAAAAMA	SETSGHQGYQ	GFRKEAGDFY	YMAGNKDPVT
TGTPQPPQRR	PSGPVQSYGP	PQGSSFGNQY	GSEGHVGQFQ	AQHSGLGGVS
HYQQDYTGPF	SPGSAQYQQQ	ASSQQQQQQV	QQLRQQLYQS	HQPLPQATGQ
PASSSSHLQP	MQRPSTLPSS	AAGYQLRVGQ	FGQHYQSSAS	SSSSSSFPSP
QRFSQSGQSY	DGSYNVNAGS	QYEGHNVGSN	AQAYGTQSNY	SYQPQSMKNF
EQAKIPQGTQ	QGQQQQQPQQ	QQHPSQHVMQ	YTNAATKLPL	QSQVGQYNQP
EVPVRSPMQF	HQNFSPISNP	SPAASVVQSP	SCSSTPSPLM	QTGENLQCGQ
GSVPMGSRNR	ILQLMPQLSP	TPSMMPSPNS	HAAGFKGFGL	EGVPEKRLTD
PGLSSLSALS	TQVANLPNTV	QHMLLSDALT	PQKKTSKRPS	SSKKADSCTN
SEGSSQPEEQ	LKSPMAESLD	GGCSSSSEDQ	GERVRQLSGQ	STSSDTTYKG
GASEKAGSSP	AQGAQNEPPR	LNASPAAREE	ATSPGAKDMP	LSSDGNPKVN
EKTVGVIVSR	EAMTGRVEKP	GGQDKGSQED	DPAATQRPPS	NGGAKETSHA
SLPQPEPPGG	GGSKGNKNGD	NNSNHNGEGN	GQSGHSAAGP	GFTSRTEPSK
SPGSLRYSYK	DSFGSAVPRN	VSGFPQYPTG	QEKGDFTGHG	ERKGRNEKFP
SLLQEVLQGY	HHHPDRRYSR	STQEHQGMAG	SLEGTTRPNV	LVSQTNELAS
RGLLNKSIGS	LLENPHWGPW	ERKSSSTAPE	MKQINLTDYP	IPRKFEIEPQ
SSAHEPGGSL	SERRSVICDI	SPLRQIVRDP	GAHSLGHMSA	DTRIGRNDRL
NPTLSQSVIL	PGGLVSMETK	LKSQSGQIKE	EDFEQSKSQA	SFNNKKSGDH
CHPPSIKHES	YRGNASPGAA	THDSLSDYGP	QDSRPTPMRR	VPGRVGGREG
MRGRSPSQYH	DFAEKLKMSP	GRSRGPGGDP	HHMNPHMTFS	ERANRSSLHT
PFSPNSETLA	SAYHANTRAH	AYGDPNAGLN	SQLHYKRQMY	QQQPEEYKDW
SSGSAQGVIA	AAQHRQEGPR	KSPRQQQFLD	RVRSPLKNDK	DGMMYGPPVG
TYHDPSAQEA	GRCLMSSDGL	PNKGMELKHG	SQKLQESCWD	LSRQTSPAKS
SGPPGMSSQK	RYGPPHETDG	HGLAEATQSS	KPGSVMLRLP	GQEDHSSQNP
LIMRRRVRSF	ISPIPSKRQS	QDVKNSSTED	KGRLLHSSKE	GADKAFNSYA
HLSHSQDIKS	IPKRDSSKDL	PSPDSRNCPA	VTLTSPAKTK	ILPPRKGRGL
KLEAIVQKIT	SPNIRRSASS	NSAEAGGDTV	TLDDILSLKS	GPPEGGSVAV
QDADIEKRKG	EVASDLVSPA	NQELHVEKPL	PRSSEEWRGS	VDDKVKTETH
AETVTAGKEP	PGAMTSTTSQ	KPGSNQGRPD	GSLGGTAPLI	FPDSKNVPPV
GILAPEANPK	AEEKENDTVT	ISPKQEGFPP	KGYFPSGKKK	GRPIGSVNKQ
KKQQQPPPPP	PQPPQIPEGS	ADGEPKPKKQ	RQRRERRKPG	AQPRKRKTKQ
AVPIVEPQEP	EIKLKYATQP	LDKTDAKNKS	FYPYIHVVNK	CELGAVCTII
NAEEEEQTKL	VRGRKGQRSL	TPPPSSTESK	ALPASSFMLQ	GPVVTESSVM
GHLVCCLCGK	WASYRNMGDL	FGPFYPQDYA	ATLPKNPPPK	RATEMQSKVK
VRHKSASNGS	KTDTEEEEEQ	QQQQKEQRSL	AAHPRFKRRH	RSEDCGGGPR
SLSRGLPCKK	AATEGSSEKT	VLDSKPSVPT	TSEGGPELEL	QIPELPLDSN
EFWVHEGCIL	WANGIYLVCG	RLYGLQEALE	IAREMKCSHC	QEAGATLGCY
NKGCSFRYHY	PCAIDADCLL	HEENFSVRCP	KHKPPLPCPL	PPLQNKTAKG
SLSTEQSERG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Rekdal C., Sjoettem E., Johansen T. (2000). The nuclear factor SPBP contains different functional domains and stimulates the activity of various transcriptional activators. J. Biol. Chem. 275: 40288—40300. PMID 10995766 DOI:10.1074/jbc.M006978200
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11631 (англ.) . Архів оригіналу за 12 серпня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UGU0 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.