SYT6

Ідентифікатори

Символи

SYT6, sytVI, synaptotagmin 6

Зовнішні ІД

OMIM: 607718 MGI: 1859544 HomoloGene: 10301 GeneCards: SYT6

Пов'язані генетичні захворювання

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • protein homodimerization activity • clathrin binding • calcium-dependent protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • calcium-dependent phospholipid binding • syntaxin binding • phosphatidylserine binding • SNARE binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • гіалоплазма • мембрана • perinuclear endoplasmic reticulum • синапс • synaptic vesicle membrane • міжклітинні контакти • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинна мембрана • extrinsic component of membrane • glutamatergic synapse • integral component of synaptic membrane • exocytic vesicle
Біологічний процес	• acrosomal vesicle exocytosis • акросомна реакція • regulation of calcium ion-dependent exocytosis • calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter • vesicle fusion • presynaptic dense core vesicle exocytosis • regulation of dopamine secretion • synaptic vesicle exocytosis • vesicle-mediated transport • calcium-ion regulated exocytosis • cellular response to calcium ion
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


148281


54524

Ensembl


ENSG00000134207


ENSMUSG00000027849

UniProt


Q5T7P8


Q9R0N8

RefSeq (мРНК)

NM_001253772 NM_001270805 NM_205848 NM_001366223 NM_001366224
NM_001366225 NM_001366226

NM_001276676 NM_001276677 NM_001276679 NM_001276680 NM_001276681
NM_018800

RefSeq (білок)

NP_001257734 NP_995320 NP_001240701 NP_001353152 NP_001353153
NP_001353154 NP_001353155

NP_001263605 NP_001263606 NP_001263608 NP_001263609 NP_001263610
NP_061270

Локус (UCSC)

Хр. 1: 114.09 – 114.15 Mb

Хр. 3: 103.48 – 103.55 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SYT6 (англ. Synaptotagmin 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 510 амінокислот, а молекулярна маса — 57 325^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGVWGAGGP	RCQEALAVLA	SLCRARPPPL	GLDVETCRSF	ELQPPERSPS
AAGAGTSVSL	LAVVVIVCGV	ALVAVFLFLF	WKLCWMPWRN	KEASSPSSAN
PPLEALQSPS	FRGNMADKLK	DPSTLGFLEA	AVKISHTSPD	IPAEVQMSVK
EHIMRHTRLQ	RQTTEPASST	RHTSFKRHLP	RQMHVSSVDY	GNELPPAAEQ
PTSIGRIKPE	LYKQKSVDGE	DAKSEATKSC	GKINFSLRYD	YETETLIVRI
LKAFDLPAKD	FCGSSDPYVK	IYLLPDRKCK	LQTRVHRKTL	NPTFDENFHF
PVPYEELADR	KLHLSVFDFD	RFSRHDMIGE	VILDNLFEAS	DLSRETSIWK
DIQYATSESV	DLGEIMFSLC	YLPTAGRLTL	TVIKCRNLKA	MDITGYSDPY
VKVSLLCDGR	RLKKKKTTIK	KNTLNPVYNE	AIIFDIPPEN	MDQVSLLISV
MDYDRVGHNE	IIGVCRVGIT	AEGLGRDHWN	EMLAYPRKPI	AHWHSLVEVK
KSFKEGNPRL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SYT6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18638 (англ.) . Архів оригіналу за 7 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q5T7P8 (англ.) . Архів оригіналу за 12 грудня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.