SYT11

Ідентифікатори

Символи

SYT11, SYT12, sytXI, synaptotagmin 11

Зовнішні ІД

OMIM: 608741 MGI: 1859547 HomoloGene: 23120 GeneCards: SYT11

Онтологія гена
Молекулярна функція	• clathrin binding • calcium ion binding • syntaxin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • translation initiation factor binding • ubiquitin protein ligase binding • SNARE binding • protein homodimerization activity • beta-tubulin binding • calcium-dependent phospholipid binding • phosphatidylserine binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • міжклітинні контакти • синапс • integral component of plasma membrane • synaptic vesicle membrane • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • везикула • phagocytic cup • presynaptic active zone membrane • inhibitory synapse • Синаптичні бульбашки • presynapse • dendritic spine • лізосома • цитоплазма • recycling endosome • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • клітинна мембрана • cell body • аксон • early phagosome • excitatory synapse • neuron projection • terminal bouton • phagocytic vesicle • perinuclear region of cytoplasm • integral component of synaptic vesicle membrane • Schaffer collateral - CA1 synapse • postsynapse • integral component of presynaptic active zone membrane • exocytic vesicle
Біологічний процес	• negative regulation of neurotransmitter secretion • regulation of phagosome maturation • regulation of defense response to bacterium • calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter • negative regulation of synaptic vesicle endocytosis • negative regulation of membrane invagination • vesicle fusion • protein homotetramerization • negative regulation of clathrin-dependent endocytosis • negative regulation of phagocytosis • positive regulation of protein localization to phagocytic vesicle • plasma membrane repair • response to wounding • negative regulation of clathrin-coated pit assembly • calcium ion regulated lysosome exocytosis • regulation of calcium ion-dependent exocytosis • regulation of dopamine secretion • vesicle-mediated transport • calcium-ion regulated exocytosis • cellular response to calcium ion
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23208


229521

Ensembl


ENSG00000132718


ENSMUSG00000068923

UniProt


Q9BT88


Q9R0N3

RefSeq (мРНК)


NM_152280


NM_018804

RefSeq (білок)


NP_689493


NP_061274

Локус (UCSC)

Хр. 1: 155.86 – 155.89 Mb

Хр. 3: 88.65 – 88.68 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SYT11 (англ. Synaptotagmin 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 431 амінокислот, а молекулярна маса — 48 297^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEITNIRPS	FDVSPVVAGL	IGASVLVVCV	SVTVFVWSCC	HQQAEKKQKN
PPYKFIHMLK	GISIYPETLS	NKKKIIKVRR	DKDGPGREGG	RRNLLVDAAE
AGLLSRDKDP	RGPSSGSCID	QLPIKMDYGE	ELRSPITSLT	PGESKTTSPS
SPEEDVMLGS	LTFSVDYNFP	KKALVVTIQE	AHGLPVMDDQ	TQGSDPYIKM
TILPDKRHRV	KTRVLRKTLD	PVFDETFTFY	GIPYSQLQDL	VLHFLVLSFD
RFSRDDVIGE	VMVPLAGVDP	STGKVQLTRD	IIKRNIQKCI	SRGELQVSLS
YQPVAQRMTV	VVLKARHLPK	MDITGLSGNP	YVKVNVYYGR	KRIAKKKTHV
KKCTLNPIFN	ESFIYDIPTD	LLPDISIEFL	VIDFDRTTKN	EVVGRLILGA
HSVTASGAEH	WREVCESPRK	PVAKWHSLSE	Y

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Huynh D.P., Scoles D.R., Nguyen D., Pulst S.M. (2003). The autosomal recessive juvenile Parkinson disease gene product, parkin, interacts with and ubiquitinates synaptotagmin XI. Hum. Mol. Genet. 12: 2587—2597. PMID 12925569 DOI:10.1093/hmg/ddg269

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19239 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9BT88 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.