SYNJ2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SYNJ2, INPP5H, synaptojanin 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609410 MGI: 1201671 HomoloGene: 117703 GeneCards: SYNJ2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • phosphoric ester hydrolase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • RNA binding • nucleic acid binding • phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate 5-phosphatase activity • phosphatidylinositol phosphate 4-phosphatase activity • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 5-phosphatase activity • phosphatidylinositol-3-phosphatase activity • phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate 3-phosphatase activity • phosphatidylinositol phosphate 5-phosphatase activity • inositol-polyphosphate 5-phosphatase activity • SH3 domain binding • PDZ domain binding • phosphatidylinositol-4-phosphate phosphatase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • membrane raft • аксон • гіалоплазма • клітинна мембрана • cell projection • цитоскелет • мембрана • cytoplasmic microtubule • extrinsic component of mitochondrial outer membrane • ruffle membrane • axon terminus • perinuclear region of cytoplasm • presynapse |
---|
Біологічний процес | • phosphatidylinositol biosynthetic process • phosphatidylinositol dephosphorylation • phosphatidylinositol-3-phosphate biosynthetic process • membrane organization • brain development • inositol phosphate dephosphorylation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001113351 NM_001113352 NM_001113353 NM_001290698 NM_011523
| NM_001357665 NM_001357667 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001106822 NP_001106823 NP_001106824 NP_001277627 NP_035653
| NP_001344594 NP_001344596 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 157.98 – 158.1 Mb | Хр. 17: 5.99 – 6.09 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SYNJ2 (англ. Synaptojanin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 496 амінокислот, а молекулярна маса — 165 538[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MALSKGLRLL | | GRLGAEGDCS | | VLLEARGRDD | | CLLFEAGTVA | | TLAPEEKEVI |
KGQYGKLTDA | | YGCLGELRLK | | SGGTSLSFLV | | LVTGCTSVGR | | IPDAEIYKIT |
ATDFYPLQEE | | AKEEERLIAL | | KKILSSGVFY | | FSWPNDGSRF | | DLTVRTQKQG |
DDSSEWGNSF | | FWNQLLHVPL | | RQHQVSCCDW | | LLKIICGVVT | | IRTVYASHKQ |
AKACLVSRVS | | CERTGTRFHT | | RGVNDDGHVS | | NFVETEQMIY | | MDDGVSSFVQ |
IRGSVPLFWE | | QPGLQVGSHH | | LRLHRGLEAN | | APAFDRHMVL | | LKEQYGQQVV |
VNLLGSRGGE | | EVLNRAFKKL | | LWASCHAGDT | | PMINFDFHQF | | AKGGKLEKLE |
TLLRPQLKLH | | WEDFDVFTKG | | ENVSPRFQKG | | TLRMNCLDCL | | DRTNTVQSFI |
ALEVLHLQLK | | TLGLSSKPIV | | DRFVESFKAM | | WSLNGHSLSK | | VFTGSRALEG |
KAKVGKLKDG | | ARSMSRTIQS | | NFFDGVKQEA | | IKLLLVGDVY | | GEEVADKGGM |
LLDSTALLVT | | PRILKAMTER | | QSEFTNFKRI | | RIAMGTWNVN | | GGKQFRSNVL |
RTAELTDWLL | | DSPQLSGATD | | SQDDSSPADI | | FAVGFEEMVE | | LSAGNIVNAS |
TTNKKMWGEQ | | LQKAISRSHR | | YILLTSAQLV | | GVCLYIFVRP | | YHVPFIRDVA |
IDTVKTGMGG | | KAGNKGAVGI | | RFQFHSTSFC | | FICSHLTAGQ | | SQVKERNEDY |
KEITQKLCFP | | MGRNVFSHDY | | VFWCGDFNYR | | IDLTYEEVFY | | FVKRQDWKKL |
LEFDQLQLQK | | SSGKIFKDFH | | EGAINFGPTY | | KYDVGSAAYD | | TSDKCRTPAW |
TDRVLWWRKK | | HPFDKTAGEL | | NLLDSDLDVD | | TKVRHTWSPG | | ALQYYGRAEL |
QASDHRPVLA | | IVEVEVQEVD | | VGARERVFQE | | VSSFQGPLDA | | TVVVNLQSPT |
LEEKNEFPED | | LRTELMQTLG | | SYGTIVLVRI | | NQGQMLVTFA | | DSHSALSVLD |
VDGMKVKGRA | | VKIRPKTKDW | | LKGLREEIIR | | KRDSMAPVSP | | TANSCLLEEN |
FDFTSLDYES | | EGDILEDDED | | YLVDEFNQPG | | VSDSELGGDD | | LSDVPGPTAL |
APPSKSPALT | | KKKQHPTYKD | | DADLVELKRE | | LEAVGEFRHR | | SPSRSLSVPN |
RPRPPQPPQR | | PPPPTGLMVK | | KSASDASISS | | GTHGQYSILQ | | TARLLPGAPQ |
QPPKARTGIS | | KPYNVKQIKT | | TNAQEAEAAI | | RCLLEARGGA | | SEEALSAVAP |
RDLEASSEPE | | PTPGAAKPET | | PQAPPLLPRR | | PPPRVPAIKK | | PTLRRTGKPL |
SPEEQFEQQT | | VHFTIGPPET | | SVEAPPVVTA | | PRVPPVPKPR | | TFQPGKAAER |
PSHRKPASDE | | APPGAGASVP | | PPLEAPPLVP | | KVPPRRKKSA | | PAAFHLQVLQ |
SNSQLLQGLT | | YNSSDSPSGH | | PPAAGTVFPQ | | GDFLSTSSAT | | SPDSDGTKAM |
KPEAAPLLGD | | YQDPFWNLLH | | HPKLLNNTWL | | SKSSDPLDSG | | TRSPKRDPID |
PVSAGASAAK | | AELPPDHEHK | | TLGHWVTISD | | QEKRTALQVF | | DPLAKT |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11504 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O15056 (англ.) . Архів оригіналу за 13 квітня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |