STRN3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4N6J

Ідентифікатори

Символи

STRN3, SG2NA, PPP2R6B, striatin 3, S/G2NA

Зовнішні ІД

OMIM: 614766 MGI: 2151064 HomoloGene: 82078 GeneCards: STRN3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • protein phosphatase 2A binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calmodulin binding • armadillo repeat domain binding • GO:0032403 protein-containing complex binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • neuronal cell body • клітинна мембрана • комплекс Ґольджі • дендрит (нейробіологія) • protein phosphatase type 2A complex • мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма • GO:0009327 protein-containing complex • FAR/SIN/STRIPAK complex
Біологічний процес	• response to estradiol • negative regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


29966


94186

Ensembl


ENSG00000196792


ENSMUSG00000020954

UniProt


Q13033


Q9ERG2

RefSeq (мРНК)


NM_001083893 NM_014574


NM_001172098 NM_052973 NM_001364437

RefSeq (білок)


NP_001077362 NP_055389


NP_001165569 NP_443205 NP_001351366

Локус (UCSC)

Хр. 14: 30.89 – 31.03 Mb

Хр. 12: 51.66 – 51.74 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

STRN3 (англ. Striatin 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 797 амінокислот, а молекулярна маса — 87 209^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDELAGGGGG	GPGMAAPPRQ	QQGPGGNLGL	SPGGNGAAGG	GGPPASEGAG
PAAGPELSRP	QQYTIPGILH	YIQHEWARFE	MERAHWEVER	AELQARIAFL
QGERKGQENL	KKDLVRRIKM	LEYALKQERA	KYHKLKYGTE	LNQGDLKMPT
FESEETKDTE	APTAPQNSQL	TWKQGRQLLR	QYLQEVGYTD	TILDVRSQRV
RSLLGLSNSE	PNGSVETKNL	EQILNGGESP	KQKGQEIKRS	SGDVLETFNF
LENADDSDED	EENDMIEGIP	EGKDKHRMNK	HKIGNEGLAA	DLTDDPDTEE
ALKEFDFLVT	AEDGEGAGEA	RSSGDGTEWD	KDDLSPTAEV	WDVDQGLISK
LKEQYKKERK	GKKGVKRANR	TKLYDMIADL	GDDELPHIPS	GIINQSRSAS
TRMTDHEGAR	AEEAEPITFP	SGGGKSFIMG	SDDVLLSVLG	LGDLADLTVT
NDADYSYDLP	ANKDAFRKTW	NPKYTLRSHF	DGVRALAFHP	VEPVLVTASE
DHTLKLWNLQ	KTVPAKKSAS	LDVEPIYTFR	AHIGPVLSLA	ISSNGEQCFS
GGIDATIQWW	NMPSPSVDPY	DTYEPNVLAG	TLVGHTDAVW	GLAYSGIKNQ
LLSCSADGTV	RLWNPQEKLP	CICTYNGDKK	HGIPTSVDFI	GCDPAHMVTS
FNTGSAVIYD	LETSQSLVIL	SSQVDSGLQS	NNHINRVVSH	PTLPVTITAH
EDRHIKFFDN	KTGKMIHSMV	AHLDAVTSLA	VDPNGIYLMS	GSHDCSIRLW
NLDSKTCVQE	ITAHRKKLDE	SIYDVAFHSS	KAYIASAGAD	ALAKVFV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

Muro Y., Chan E.K., Landberg G., Tan E.M. (1995). A cell-cycle nuclear autoantigen containing WD-40 motifs expressed mainly in S and G2 phase cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 207: 1029—1037. PMID 7864889 DOI:10.1006/bbrc.1995.1288
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15720 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q13033 (англ.) . Архів оригіналу за 23 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.