SSH1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SSH1, SSH1L, slingshot protein phosphatase 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606778 MGI: 2686240 HomoloGene: 41299 GeneCards: SSH1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • phosphoprotein phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein tyrosine phosphatase activity • actin binding • hydrolase activity • protein tyrosine/serine/threonine phosphatase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • cell projection • клітинна мембрана • midbody • Борозна розщеплення • цитоскелет • lamellipodium • гіалоплазма • growth cone • cell leading edge • мембрана • integral component of membrane |
---|
Біологічний процес | • regulation of lamellipodium assembly • GO:0016576 protein dephosphorylation • regulation of axonogenesis • regulation of actin polymerization or depolymerization • GO:0000767 cell morphogenesis • GO:0051199 regulation of cellular protein metabolic process • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • cellular response to ATP • actin cytoskeleton organization • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • positive regulation of synaptic plasticity • excitatory chemical synaptic transmission • positive regulation of neuron death • positive regulation of AMPA glutamate receptor clustering • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell migration • positive regulation of excitatory postsynaptic potential |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001161330 NM_001161331 NM_018984 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001154802 NP_001154803 NP_061857 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 108.78 – 108.86 Mb | Хр. 5: 114.08 – 114.13 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SSH1 (англ. Slingshot protein phosphatase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 049 амінокислот, а молекулярна маса — 115 511[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MALVTLQRSP | | TPSAASSSAS | | NSELEAGSEE | | DRKLNLSLSE | | SFFMVKGAAL |
FLQQGSSPQG | | QRSLQHPHKH | | AGDLPQHLQV | | MINLLRCEDR | | IKLAVRLESA |
WADRVRYMVV | | VYSSGRQDTE | | ENILLGVDFS | | SKESKSCTIG | | MVLRLWSDTK |
IHLDGDGGFS | | VSTAGRMHIF | | KPVSVQAMWS | | ALQVLHKACE | | VARRHNYFPG |
GVALIWATYY | | ESCISSEQSC | | INEWNAMQDL | | ESTRPDSPAL | | FVDKPTEGER |
TERLIKAKLR | | SIMMSQDLEN | | VTSKEIRNEL | | EKQMNCNLKE | | LKEFIDNEML |
LILGQMDKPS | | LIFDHLYLGS | | EWNASNLEEL | | QGSGVDYILN | | VTREIDNFFP |
GLFAYHNIRV | | YDEETTDLLA | | HWNEAYHFIN | | KAKRNHSKCL | | VHCKMGVSRS |
ASTVIAYAMK | | EFGWPLEKAY | | NYVKQKRSIT | | RPNAGFMRQL | | SEYEGILDAS |
KQRHNKLWRQ | | QTDSSLQQPV | | DDPAGPGDFL | | PETPDGTPES | | QLPFLDDAAQ |
PGLGPPLPCC | | FRRLSDPLLP | | SPEDETGSLV | | HLEDPEREAL | | LEEAAPPAEV |
HRPARQPQQG | | SGLCEKDVKK | | KLEFGSPKGR | | SGSLLQVEET | | EREEGLGAGR |
WGQLPTQLDQ | | NLLNSENLNN | | NSKRSCPNGM | | EDDAIFGILN | | KVKPSYKSCA |
DCMYPTASGA | | PEASRERCED | | PNAPAICTQP | | AFLPHITSSP | | VAHLASRSRV |
PEKPASGPTE | | PPPFLPPAGS | | RRADTSGPGA | | GAALEPPASL | | LEPSRETPKV |
LPKSLLLKNS | | HCDKNPPSTE | | VVIKEESSPK | | KDMKPAKDLR | | LLFSNESEKP |
TTNSYLMQHQ | | ESIIQLQKAG | | LVRKHTKELE | | RLKSVPADPA | | PPSRDGPASR |
LEASIPEESQ | | DPAALHELGP | | LVMPSQAGSD | | EKSEAAPASL | | EGGSLKSPPP |
FFYRLDHTSS | | FSKDFLKTIC | | YTPTSSSMSS | | NLTRSSSSDS | | IHSVRGKPGL |
VKQRTQEIET | | RLRLAGLTVS | | SPLKRSHSLA | | KLGSLTFSTE | | DLSSEADPST |
VADSQDTTLS | | ESSFLHEPQG | | TPRDPAATSK | | PSGKPAPENL | | KSPSWMSKS |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках.
Література
- Niwa R., Nagata-Ohashi K., Takeichi M., Mizuno K., Uemura T. (2002). Control of actin reorganization by Slingshot, a family of phosphatases that dephosphorylate ADF/cofilin. Cell. 108: 233—246. PMID 11832213 DOI:10.1016/S0092-8674(01)00638-9
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Dai S., Sarmiere P.D., Wiggan O., Bamburg J.R., Zhou D. (2004). Efficient Salmonella entry requires activity cycles of host ADF and cofilin. Cell. Microbiol. 6: 459—471. PMID 15056216 DOI:10.1111/j.1462-5822.2004.00375.x
- Wang Y., Shibasaki F., Mizuno K. (2005). Calcium signal-induced cofilin dephosphorylation is mediated by Slingshot via calcineurin. J. Biol. Chem. 280: 12683—12689. PMID 15671020 DOI:10.1074/jbc.M411494200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30579 (англ.) . Архів оригіналу за 27 листопада 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8WYL5 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |