SRRM2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SRRM2, 300-KD, CWF21, Cwc21, SRL300, SRm300, HSPC075, serine/arginine repetitive matrix 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606032 MGI: 1923206 HomoloGene: 130678 GeneCards: SRRM2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • C2H2 zinc finger domain binding • protein N-terminus binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • Тільце Кахаля • nuclear speck • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • U2-type catalytic step 2 spliceosome • U2-type precatalytic spliceosome |
---|
Біологічний процес | • mRNA processing • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 2.75 – 2.77 Mb | Хр. 17: 24.01 – 24.04 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SRRM2 (англ. Serine/arginine repetitive matrix 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 752 амінокислот, а молекулярна маса — 299 615[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MYNGIGLPTP | | RGSGTNGYVQ | | RNLSLVRGRR | | GERPDYKGEE | | ELRRLEAALV |
KRPNPDILDH | | ERKRRVELRC | | LELEEMMEEQ | | GYEEQQIQEK | | VATFRLMLLE |
KDVNPGGKEE | | TPGQRPAVTE | | THQLAELNEK | | KNERLRAAFG | | ISDSYVDGSS |
FDPQRRAREA | | KQPAPEPPKP | | YSLVRESSSS | | RSPTPKQKKK | | KKKKDRGRRS |
ESSSPRRERK | | KSSKKKKHRS | | ESESKKRKHR | | SPTPKSKRKS | | KDKKRKRSRS |
TTPAPKSRRA | | HRSTSADSAS | | SSDTSRSRSR | | SAAAKTHTTA | | LAGRSPSPAS |
GRRGEGDAPF | | SEPGTTSTQR | | PSSPETATKQ | | PSSPYEDKDK | | DKKEKSATRP |
SPSPERSSTG | | PEPPAPTPLL | | AERHGGSPQP | | LATTPLSQEP | | VNPPSEASPT |
RDRSPPKSPE | | KLPQSSSSES | | SPPSPQPTKV | | SRHASSSPES | | PKPAPAPGSH |
REISSSPTSK | | NRSHGRAKRD | | KSHSHTPSRR | | MGRSRSPATA | | KRGRSRSRTP |
TKRGHSRSRS | | PQWRRSRSAQ | | RWGRSRSPQR | | RGRSRSPQRP | | GWSRSRNTQR |
RGRSRSARRG | | RSHSRSPATR | | GRSRSRTPAR | | RGRSRSRTPA | | RRRSRSRTPT |
RRRSRSRTPA | | RRGRSRSRTP | | ARRRSRTRSP | | VRRRSRSRSP | | ARRSGRSRSR |
TPARRGRSRS | | RTPARRGRSR | | SRTPARRSGR | | SRSRTPARRG | | RSRSRTPRRG |
RSRSRSLVRR | | GRSHSRTPQR | | RGRSGSSSER | | KNKSRTSQRR | | SRSNSSPEMK |
KSRISSRRSR | | SLSSPRSKAK | | SRLSLRRSLS | | GSSPCPKQKS | | QTPPRRSRSG |
SSQPKAKSRT | | PPRRSRSSSS | | PPPKQKSKTP | | SRQSHSSSSP | | HPKVKSGTPP |
RQGSITSPQA | | NEQSVTPQRR | | SCFESSPDPE | | LKSRTPSRHS | | CSGSSPPRVK |
SSTPPRQSPS | | RSSSPQPKVK | | AIISPRQRSH | | SGSSSPSPSR | | VTSRTTPRRS |
RSVSPCSNVE | | SRLLPRYSHS | | GSSSPDTKVK | | PETPPRQSHS | | GSISPYPKVK |
AQTPPGPSLS | | GSKSPCPQEK | | SKDSLVQSCP | | GSLSLCAGVK | | SSTPPGESYF |
GVSSLQLKGQ | | SQTSPDHRSD | | TSSPEVRQSH | | SESPSLQSKS | | QTSPKGGRSR |
SSSPVTELAS | | RSPIRQDRGE | | FSASPMLKSG | | MSPEQSRFQS | | DSSSYPTVDS |
NSLLGQSRLE | | TAESKEKMAL | | PPQEDATASP | | PRQKDKFSPF | | PVQDRPESSL |
VFKDTLRTPP | | RERSGAGSSP | | ETKEQNSALP | | TSSQDEELME | | VVEKSEEPAG |
QILSHLSSEL | | KEMSTSNFES | | SPEVEERPAV | | SLTLDQSQSQ | | ASLEAVEVPS |
MASSWGGPHF | | SPEHKELSNS | | PLRENSFGSP | | LEFRNSGPLG | | TEMNTGFSSE |
VKEDLNGPFL | | NQLETDPSLD | | MKEQSTRSSG | | HSSSELSPDA | | VEKAGMSSNQ |
SISSPVLDAV | | PRTPSRERSS | | SASSPEMKDG | | LPRTPSRRSR | | SGSSPGLRDG |
SGTPSRHSLS | | GSSPGMKDIP | | RTPSRGRSEC | | DSSPEPKALP | | QTPRPRSRSP |
SSPELNNKCL | | TPQRERSGSE | | SSVDQKTVAR | | TPLGQRSRSG | | SSQELDVKPS |
ASPQERSESD | | SSPDSKAKTR | | TPLRQRSRSG | | SSPEVDSKSR | | LSPRRSRSGS |
SPEVKDKPRA | | APRAQSGSDS | | SPEPKAPAPR | | ALPRRSRSGS | | SSKGRGPSPE |
GSSSTESSPE | | HPPKSRTARR | | GSRSSPEPKT | | KSRTPPRRRS | | SRSSPELTRK |
ARLSRRSRSA | | SSSPETRSRT | | PPRHRRSPSV | | SSPEPAEKSR | | SSRRRRSASS |
PRTKTTSRRG | | RSPSPKPRGL | | QRSRSRSRRE | | KTRTTRRRDR | | SGSSQSTSRR |
RQRSRSRSRV | | TRRRRGGSGY | | HSRSPARQES | | SRTSSRRRRG | | RSRTPPTSRK |
RSRSRTSPAP | | WKRSRSRASP | | ATHRRSRSRT | | PLISRRRSRS | | RTSPVSRRRS |
RSRTSVTRRR | | SRSRASPVSR | | RRSRSRTPPV | | TRRRSRSRTP | | TTRRRSRSRT |
PPVTRRRSRS | | RTPPVTRRRS | | RSRTSPITRR | | RSRSRTSPVT | | RRRSRSRTSP |
VTRRRSRSRT | | SPVTRRRSRS | | RTPPAIRRRS | | RSRTPLLPRK | | RSRSRSPLAI |
RRRSRSRTPR | | TARGKRSLTR | | SPPAIRRRSA | | SGSSSDRSRS | | ATPPATRNHS |
GSRTPPVALN | | SSRMSCFSRP | | SMSPTPLDRC | | RSPGMLEPLG | | SSRTPMSVLQ |
QAGGSMMDGP | | GPRIPDHQRT | | SVPENHAQSR | | IALALTAISL | | GTARPPPSMS |
AAGLAARMSQ | | VPAPVPLMSL | | RTAPAANLAS | | RIPAASAAAM | | NLASARTPAI |
PTAVNLADSR | | TPAAAAAMNL | | ASPRTAVAPS | | AVNLADPRTP | | TAPAVNLAGA |
RTPAALAALS | | LTGSGTPPTA | | ANYPSSSRTP | | QAPASANLVG | | PRSAHATAPV |
NIAGSRTAAA | | LAPASLTSAR | | MAPALSGANL | | TSPRVPLSAY | | ERVSGRTSPP |
LLDRARSRTP | | PSAPSQSRMT | | SERAPSPSSR | | MGQAPSQSLL | | PPAQDQPRSP |
VPSAFSDQSR | | CLIAQTTPVA | | GSQSLSSGAV | | ATTTSSAGDH | | NGMLSVPAPG |
VPHSDVGEPP | | ASTGAQQPSA | | LAALQPAKER | | RSSSSSSSSS | | SSSSSSSSSS |
SSSSSSGSSS | | SDSEGSSLPV | | QPEVALKRVP | | SPTPAPKEAV | | REGRPPEPTP |
AKRKRRSSSS | | SSSSSSSSSS | | SSSSSSSSSS | | SSSSSSSSSS | | SSSSSSSSPS |
PAKPGPQALP | | KPASPKKPPP | | GERRSRSPRK | | PIDSLRDSRS | | LSYSPVERRR |
PSPQPSPRDQ | | QSSSSERGSR | | RGQRGDSRSP | | SHKRRRETPS | | PRPMRHRSSR |
SP |
Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Blencowe B.J., Issner R., Nickerson J.A., Sharp P.A. (1998). A coactivator of pre-mRNA splicing. Genes Dev. 12: 996—1009. PMID 9531537 DOI:10.1101/gad.12.7.996
- Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Grainger R.J., Barrass J.D., Jacquier A., Rain J.-C., Beggs J.D. (2009). Physical and genetic interactions of yeast Cwc21p, an ortholog of human SRm300/SRRM2, suggest a role at the catalytic center of the spliceosome. RNA. 15: 2161—2173. PMID 19854871 DOI:10.1261/rna.1908309
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16639 (англ.) . Процитовано 27 лютого 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9UQ35 (англ.) . Архів оригіналу за 8 березня 2017. Процитовано 27 лютого 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |