SPON1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2ZOT, 2ZOU, 3COO, 3Q13

Ідентифікатори

Символи

SPON1, VSGP/F-spondin, f-spondin, Spondin 1

Зовнішні ІД

OMIM: 604989 MGI: 2385287 HomoloGene: 4453 GeneCards: SPON1

Пов'язані генетичні захворювання

туберкульоз^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • extracellular matrix structural constituent • LBD domain binding
Клітинна компонента	• GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular region • endoplasmic reticulum lumen • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix
Біологічний процес	• адгезія клітин • protein O-linked fucosylation • positive regulation of protein processing • positive regulation of protein binding • negative regulation of amyloid-beta formation • positive regulation of amyloid precursor protein catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10418


233744

Ensembl


ENSG00000262655


ENSMUSG00000038156

UniProt


Q9HCB6


Q8VCC9

RefSeq (мРНК)


NM_006108


NM_145584

RefSeq (білок)


NP_006099


NP_663559

Локус (UCSC)

Хр. 11: 13.96 – 14.27 Mb

Хр. 7: 113.37 – 113.64 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SPON1 (англ. Spondin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 807 амінокислот, а молекулярна маса — 90 973^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRLSPAPLKL	SRTPALLALA	LPLAAALAFS	DETLDKVPKS	EGYCSRILRA
QGTRREGYTE	FSLRVEGDPD	FYKPGTSYRV	TLSAAPPSYF	RGFTLIALRE
NREGDKEEDH	AGTFQIIDEE	ETQFMSNCPV	AVTESTPRRR	TRIQVFWIAP
PAGTGCVILK	ASIVQKRIIY	FQDEGSLTKK	LCEQDSTFDG	VTDKPILDCC
ACGTAKYRLT	FYGNWSEKTH	PKDYPRRANH	WSAIIGGSHS	KNYVLWEYGG
YASEGVKQVA	ELGSPVKMEE	EIRQQSDEVL	TVIKAKAQWP	AWQPLNVRAA
PSAEFSVDRT	RHLMSFLTMM	GPSPDWNVGL	SAEDLCTKEC	GWVQKVVQDL
IPWDAGTDSG	VTYESPNKPT	IPQEKIRPLT	SLDHPQSPFY	DPEGGSITQV
ARVVIERIAR	KGEQCNIVPD	NVDDIVADLA	PEEKDEDDTP	ETCIYSNWSP
WSACSSSTCD	KGKRMRQRML	KAQLDLSVPC	PDTQDFQPCM	GPGCSDEDGS
TCTMSEWITW	SPCSISCGMG	MRSRERYVKQ	FPEDGSVCTL	PTEETEKCTV
NEECSPSSCL	MTEWGEWDEC	SATCGMGMKK	RHRMIKMNPA	DGSMCKAETS
QAEKCMMPEC	HTIPCLLSPW	SEWSDCSVTC	GKGMRTRQRM	LKSLAELGDC
NEDLEQVEKC	MLPECPIDCE	LTEWSQWSEC	NKSCGKGHVI	RTRMIQMEPQ
FGGAPCPETV	QRKKCRIRKC	LRNPSIQKLR	WREARESRRS	EQLKEESEGE
QFPGCRMRPW	TAWSECTKLC	GGGIQERYMT	VKKRFKSSQF	TSCKDKKEIR
ACNVHPC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tan K., Duquette M., Liu J.H., Lawler J., Wang J.H. (2008). The crystal structure of the heparin-binding reelin-N domain of f-spondin. J. Mol. Biol. 381: 1213—1223. PMID 18602404 DOI:10.1016/j.jmb.2008.06.045
Tan K., Lawler J. (2011). The structure of the Ca+-binding, glycosylated F-spondin domain of F-spondin - A C2-domain variant in an extracellular matrix protein. BMC Struct. Biol. 11: 22—22. PMID 21569239 DOI:10.1186/1472-6807-11-22

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SPON1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11252 (англ.) . Архів оригіналу за 6 травня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9HCB6 (англ.) . Архів оригіналу за 24 лютого 2018. Процитовано 8 вересня 2017.