SPOCK2

Ідентифікатори

Символи

SPOCK2, testican-2, sparc/osteonectin, cwcv and kazal-like domains proteoglycan (testican) 2, SPARC/osteonectin, cwcv and kazal like domains proteoglycan 2, SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 2

Зовнішні ІД

OMIM: 607988 MGI: 1891351 HomoloGene: 8854 GeneCards: SPOCK2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • glycosaminoglycan binding • extracellular matrix binding • metalloendopeptidase inhibitor activity • collagen binding
Клітинна компонента	• extracellular region • GO:0005578 Позаклітинна матриця • міжклітинний простір
Біологічний процес	• регуляція диференціювання клітин • synapse assembly • peptide cross-linking via chondroitin 4-sulfate glycosaminoglycan • extracellular matrix organization • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of cell-substrate adhesion • negative regulation of endopeptidase activity • positive regulation of cell motility • cellular response to leukemia inhibitory factor
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9806


94214

Ensembl


ENSG00000107742


ENSMUSG00000058297

UniProt


Q92563


Q9ER58

RefSeq (мРНК)


NM_001134434 NM_001244950 NM_014767


NM_052994

RefSeq (білок)


NP_001127906 NP_001231879 NP_055582


NP_443720

Локус (UCSC)

Хр. 10: 72.06 – 72.09 Mb

Хр. 10: 59.94 – 59.97 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SPOCK2 (англ. SPARC/osteonectin, cwcv and kazal like domains proteoglycan 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 424 амінокислот, а молекулярна маса — 46 779^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRAPGCGRLV	LPLLLLAAAA	LAEGDAKGLK	EGETPGNFME	DEQWLSSISQ
YSGKIKHWNR	FRDEVEDDYI	KSWEDNQQGD	EALDTTKDPC	QKVKCSRHKV
CIAQGYQRAM	CISRKKLEHR	IKQPTVKLHG	NKDSICKPCH	MAQLASVCGS
DGHTYSSVCK	LEQQACLSSK	QLAVRCEGPC	PCPTEQAATS	TADGKPETCT
GQDLADLGDR	LRDWFQLLHE	NSKQNGSASS	VAGPASGLDK	SLGASCKDSI
GWMFSKLDTS	ADLFLDQTEL	AAINLDKYEV	CIRPFFNSCD	TYKDGRVSTA
EWCFCFWREK	PPCLAELERI	QIQEAAKKKP	GIFIPSCDED	GYYRKMQCDQ
SSGDCWCVDQ	LGLELTGTRT	HGSPDCDDIV	GFSGDFGSGV	GWEDEEEKET
EEAGEEAEEE	EGEAGEADDG	GYIW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13564 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q92563 (англ.) . Архів оригіналу за 17 листопада 2016. Процитовано 8 вересня 2017.