SP110

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1UFN

Ідентифікатори

Символи

SP110, IFI41, IFI75, IPR1, VODI, SP110 nuclear body protein

Зовнішні ІД

OMIM: 604457 MGI: 3783243 HomoloGene: 82192 GeneCards: SP110

Пов'язані генетичні захворювання

ожиріння, hepatic veno-occlusive disease with immunodeficiency^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• signal transducer activity • зв'язування з іоном металу • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0022415 viral process • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3431


101056250

Ensembl


ENSG00000135899


н/д

UniProt


Q9HB58


н/д

RefSeq (мРНК)

NM_001185015 NM_004509 NM_004510 NM_080424 NM_001378442
NM_001378443 NM_001378444 NM_001378445 NM_001378446 NM_001378447


н/д

RefSeq (білок)

NP_001171944 NP_004500 NP_004501 NP_536349 NP_001365371
NP_001365372 NP_001365373 NP_001365374 NP_001365375 NP_001365376


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 2: 230.17 – 230.23 Mb

н/д

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SP110 (англ. SP110 nuclear body protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 689 амінокислот, а молекулярна маса — 78 396^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFTMTRAMEE	ALFQHFMHQK	LGIAYAIHKP	FPFFEGLLDN	SIITKRMYME
SLEACRNLIP	VSRVVHNILT	QLERTFNLSL	LVTLFSQINL	REYPNLVTIY
RSFKRVGASY	EWQSRDTPIL	LEAPTGLAEG	SSLHTPLALP	PPQPPQPSCS
PCAPRVSEPG	TSSQQSDEIL	SESPSPSDPV	LPLPALIQEG	RSTSVTNDKL
TSKMNAEEDS	EEMPSLLTST	VQVASDNLIP	QIRDKEDPQE	MPHSPLGSMP
EIRDNSPEPN	DPEEPQEVSS	TPSDKKGKKR	KRCIWSTPKR	RHKKKSLPGG
TASSRHGIQK	KLKRVDQVPQ	KKDDSTCNST	VETRAQKART	ECARKSRSEE
IIDGTSEMNE	GKRSQKTPST	PRRVTQGAAS	PGHGIQEKLQ	VVDKVTQRKD
DSTWNSEVMM	RVQKARTKCA	RKSRLKEKKK	EKDICSSSKR	RFQKNIHRRG
KPKSDTVDFH	CSKLPVTCGE	AKGILYKKKM	KHGSSVKCIR	NEDGTWLTPN
EFEVEGKGRN	AKNWKRNIRC	EGMTLGELLK	RKNSDECEVC	CQGGQLLCCG
TCPRVFHEDC	HIPPVEAKRM	LWSCTFCRMK	RSSGSQQCHH	VSKTLERQMQ
PQDQLIRDYG	EPFQEAMWLD	LVKERLITEM	YTVAWFVRDM	RLMFRNHKTF
YKASDFGQVG	LDLEAEFEKD	LKDVLGFHEA	NDGGFWTLP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
Kadereit S., Gewert D.R., Galabru J., Hovanessian A.G., Meurs E.F. (1993). Molecular cloning of two new interferon-induced, highly related nuclear phosphoproteins. J. Biol. Chem. 268: 24432—24441. PMID 7693701

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SP110 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5401 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9HB58 (англ.) . Архів оригіналу за 27 січня 2018. Процитовано 28 серпня 2017.