SORBS3 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2CT3, 2DLM, 2NWM, 2YUP | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SORBS3, SCAM-1, SCAM1, SH3D4, sorbin and SH3 domain containing 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610795 MGI: 700013 HomoloGene: 4218 GeneCards: SORBS3 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
ВІЛ-заворювання[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • vinculin binding • transcription factor binding • structural constituent of cytoskeleton • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • міжклітинні контакти • цитоскелет • клітинне ядро • focal adhesion |
---|
Біологічний процес | • cell-substrate adhesion • адгезія клітин • м'язове скорочення • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of stress fiber assembly • positive regulation of cytoskeleton organization • positive regulation of MAPK cascade • actin filament organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001271407 NM_001271408 NM_001271409 NM_011366 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001258336 NP_001258337 NP_001258338 NP_035496 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 22.54 – 22.58 Mb | Хр. 14: 70.42 – 70.45 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SORBS3 (англ. Sorbin and SH3 domain containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 671 амінокислот, а молекулярна маса — 75 341[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MQGPPRSLRA | | GLSLDDFIPG | | HLQSHIGSSS | | RGTRVPVIRN | | GGSNTLNFQF |
HDPAPRTVCN | | GGYTPRRDAS | | QHPDPAWYQT | | WPGPGSKPSA | | STKIPASQHT |
QNWSATWTKD | | SKRRDKRWVK | | YEGIGPVDES | | GMPIAPRSSV | | DRPRDWYRRM |
FQQIHRKMPD | | LQLDWTFEEP | | PRDPRHLGAQ | | QRPAHRPGPA | | TSSSGRSWDH |
SEELPRSTFN | | YRPGAFSTVL | | QPSNQVLRRR | | EKVDNVWTEE | | SWNQFLQELE |
TGQRPKKPLV | | DDPGEKPSQP | | IEVLLERELA | | ELSAELDKDL | | RAIETRLPSP |
KSSPAPRRAP | | EQRPPAGPAS | | AWSSSYPHAP | | YLGSARSLSP | | HKMADGGSPF |
LGRRDFVYPS | | STRDPSASNG | | GGSPARREEK | | KRKAARLKFD | | FQAQSPKELT |
LQKGDIVYIH | | KEVDKNWLEG | | EHHGRLGIFP | | ANYVEVLPAD | | EIPKPIKPPT |
YQVLEYGEAV | | AQYTFKGDLE | | VELSFRKGEH | | ICLIRKVNEN | | WYEGRITGTG |
RQGIFPASYV | | QVSREPRLRL | | CDDGPQLPTS | | PRLTAAARSA | | RHPSSPSALR |
SPADPIDLGG | | QTSPRRTGFS | | FPTQEPRPQT | | QNLGTPGPAL | | SHSRGPSHPL |
DLGTSSPNTS | | QIHWTPYRAM | | YQYRPQNEDE | | LELREGDRVD | | VMQQCDDGWF |
VGVSRRTQKF | | GTFPGNYVAP | | V |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних контактах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Voss M., Lettau M., Janssen O. (2009). Identification of SH3 domain interaction partners of human FasL (CD178) by phage display screening. BMC Immunol. 10: 53—53. PMID 19807924 DOI:10.1186/1471-2172-10-53
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SORBS3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30907 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O60504 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |