SORBS2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4IGZ

Ідентифікатори

Символи

SORBS2, ARGBP2, PRO0618, sorbin and SH3 domain containing 2

Зовнішні ІД

OMIM: 616349 MGI: 1924574 HomoloGene: 83295 GeneCards: SORBS2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• structural constituent of cytoskeleton • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cytoskeletal anchor activity • structural constituent of muscle • RNA binding • nucleic acid binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • cell projection • мембрана • focal adhesion • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • Z disc • apical plasma membrane • actin cytoskeleton • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро • lamellipodium • нуклеоплазма
Біологічний процес	• cell growth involved in cardiac muscle cell development • actin filament organization • Сигнальний шлях Notch • GO:0022610 життєдіяльність
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8470


234214

Ensembl


ENSG00000154556


ENSMUSG00000031626

UniProt


O94875


Q3UTJ2

RefSeq (мРНК)

NM_001145670 NM_001145671 NM_001145672 NM_001145673 NM_001145674
NM_001145675 NM_001270771 NM_003603 NM_021069


NM_001205219 NM_172752 NM_001310707 NM_001310708

RefSeq (білок)

NP_001139142 NP_001139143 NP_001139144 NP_001139145 NP_001139146
NP_001139147 NP_001257700 NP_003594 NP_066547

NP_001192148 NP_001297636 NP_001297637 NP_766340 NP_001389592
NP_001389593 NP_001389594 NP_001389595 NP_001389596 NP_001389597 NP_001389598 NP_001389599 NP_001389600 NP_001389601 NP_001389602 NP_001389603 NP_001389604

Локус (UCSC)

Хр. 4: 185.59 – 185.96 Mb

Хр. 8: 45.96 – 46.28 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SORBS2 (англ. Sorbin and SH3 domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 100 амінокислот, а молекулярна маса — 124 108^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSYYQRPFSP	SAYSLPASLN	SSIVMQHGTS	LDSTDTYPQH	AQSLDGTTSS
SIPLYRSSEE	EKRVTVIKAP	HYPGIGPVDE	SGIPTAIRTT	VDRPKDWYKT
MFKQIHMVHK	PDDDTDMYNT	PYTYNAGLYN	PPYSAQSHPA	AKTQTYRPLS
KSHSDNSPNA	FKDASSPVPP	PHVPPPVPPL	RPRDRSSTEK	HDWDPPDRKV
DTRKFRSEPR	SIFEYEPGKS	SILQHERPAS	LYQSSIDRSL	ERPMSSASMA
SDFRKRRKSE	PAVGPPRGLG	DQSASRTSPG	RVDLPGSSTT	LTKSFTSSSP
SSPSRAKGGD	DSKICPSLCS	YSGLNGNPSS	ELDYCSTYRQ	HLDVPRDSPR
AISFKNGWQM	ARQNAEIWSS	TEETVSPKIK	SRSCDDLLND	DCDSFPDPKV
KSESMGSLLC	EEDSKESCPM	AWGSPYVPEV	RSNGRSRIRH	RSARNAPGFL
KMYKKMHRIN	RKDLMNSEVI	CSVKSRILQY	ESEQQHKDLL	RAWSQCSTEE
VPRDMVPTRI	SEFEKLIQKS	KSMPNLGDDM	LSPVTLEPPQ	NGLCPKRRFS
IEYLLEEENQ	SGPPARGRRG	CQSNALVPIH	IEVTSDEQPR	AHVEFSDSDQ
DGVVSDHSDY	IHLEGSSFCS	ESDFDHFSFT	SSESFYGSSH	HHHHHHHHHH
RHLISSCKGR	CPASYTRFTT	MLKHERARHE	NTEEPRRQEM	DPGLSKLAFL
VSPVPFRRKK	NSAPKKQTEK	AKCKASVFEA	LDSALKDICD	QIKAEKKRGS
LPDNSILHRL	ISELLPDVPE	RNSSLRALRR	SPLHQPLHPL	PPDGAIHCPP
YQNDCGRMPR	SASFQDVDTA	NSSCHHQDRG	GALQDRESPR	SYSSTLTDMG
RSAPRERRGT	PEKEKLPAKA	VYDFKAQTSK	ELSFKKGDTV	YILRKIDQNW
YEGEHHGRVG	IFPISYVEKL	TPPEKAQPAR	PPPPAQPGEI	GEAIAKYNFN
ADTNVELSLR	KGDRVILLKR	VDQNWYEGKI	PGTNRQGIFP	VSYVEVVKKN
TKGAEDYPDP	PIPHSYSSDR	IHSLSSNKPQ	RPVFTHENIQ	GGGEPFQALY
NYTPRNEDEL	ELRESDVIDV	MEKCDDGWFV	GTSRRTKFFG	TFPGNYVKRL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

Wang B., Golemis E.A., Kruh G.D. (1997). ArgBP2, a multiple Src homology 3 domain-containing, Arg/Abl-interacting protein, is phosphorylated in v-Abl-transformed cells and localized in stress fibers and cardiocyte Z-disks. J. Biol. Chem. 272: 17542—17550. PMID 9211900 DOI:10.1074/jbc.272.28.17542
Wahbi K., Magaud J.-P., Pansu D., Descroix-Vagne M. (2001). Coding region of the sorbin gene in different species. Peptides. 22: 2045—2053. PMID 11786189 DOI:10.1016/S0196-9781(01)00558-7
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Soubeyran P., Barac A., Szymkiewicz I., Dikic I. (2003). Cbl-ArgBP2 complex mediates ubiquitination and degradation of c-Abl. Biochem. J. 370: 29—34. PMID 12475393 DOI:10.1042/BJ20021539

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24098 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, O94875 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.