SNX3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2YPS, 2MXC

Ідентифікатори

Символи

SNX3, Grd19, MCOPS8, SDP3, sorting nexin 3

Зовнішні ІД

OMIM: 605930 MGI: 1860188 HomoloGene: 36144 GeneCards: SNX3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphatidylinositol-3-phosphate binding • phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding • phosphatidylinositol-4-phosphate binding • phosphatidylinositol-5-phosphate binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • protein phosphatase binding • lipid binding • phosphatidylinositol phosphate binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • ендосома • early endosome membrane • early phagosome • retromer complex • early endosome • phagocytic vesicle • екзосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • clathrin-coated vesicle • extrinsic component of membrane • endosome membrane
Біологічний процес	• protein to membrane docking • negative regulation of viral entry into host cell • negative regulation of phagocytosis • response to bacterium • GO:1903363 negative regulation of protein catabolic process • negative regulation of early endosome to late endosome transport • membrane invagination • regulation of Wnt signaling pathway • intralumenal vesicle formation • negative regulation of protein transport • positive regulation of neuron projection development • protein transport • Wnt signaling pathway • protein deubiquitination • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8724


54198

Ensembl


ENSG00000112335


ENSMUSG00000019804

UniProt


O60493


O70492

RefSeq (мРНК)


NM_152828 NM_001300928 NM_001300929 NM_003795 NM_152827


NM_017472

RefSeq (білок)


NP_001287857 NP_001287858 NP_003786 NP_690040


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 6: 108.21 – 108.26 Mb

Хр. 10: 42.38 – 42.41 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNX3 (англ. Sorting nexin 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 162 амінокислот, а молекулярна маса — 18 762^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAETVADTRR	LITKPQNLND	AYGPPSNFLE	IDVSNPQTVG	VGRGRFTTYE
IRVKTNLPIF	KLKESTVRRR	YSDFEWLRSE	LERESKVVVP	PLPGKAFLRQ
LPFRGDDGIF	DDNFIEERKQ	GLEQFINKVA	GHPLAQNERC	LHMFLQDEII
DKSYTPSKIR	HA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазматичних везикулах, ендосомах.

Література

Haft C.R., de la Luz Sierra M., Barr V.A., Haft D.H., Taylor S.I. (1998). Identification of a family of sorting nexin molecules and characterization of their association with receptors. Mol. Cell. Biol. 18: 7278—7287. PMID 9819414 DOI:10.1128/MCB.18.12.7278
Xu Y., Hortsman H., Seet L., Wong S.H., Hong W. (2001). SNX3 regulates endosomal function through its PX-domain-mediated interaction with PtdIns(3)P. Nat. Cell Biol. 3: 658—666. PMID 11433298 DOI:10.1038/35083051
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chua R.Y., Wong S.H. (2013). SNX3 recruits to phagosomes and negatively regulates phagocytosis in dendritic cells. Immunology. 139: 30—47. PMID 23237080 DOI:10.1111/imm.12051

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11174 (англ.) . Архів оригіналу за 5 липня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, O60493 (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.