SNX2

Ідентифікатори

Символи

SNX2, TRG-9, sorting nexin 2

Зовнішні ІД

OMIM: 605929 MGI: 1915054 HomoloGene: 2332 GeneCards: SNX2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity • insulin receptor binding • leptin receptor binding • epidermal growth factor receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • protein heterodimerization activity • transferrin receptor binding • lipid binding • cadherin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • cell projection • early endosome membrane • мембрана • retromer, tubulation complex • retromer complex • endosome membrane • lamellipodium • extrinsic component of membrane • гіалоплазма • лізосома • ендосома • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• ендоцитоз • vesicle organization • early endosome to Golgi transport • retrograde transport, endosome to Golgi • protein complex oligomerization • protein transport • intracellular protein transport • lamellipodium morphogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6643


67804

Ensembl


ENSG00000205302


ENSMUSG00000034484

UniProt


O60749


Q9CWK8

RefSeq (мРНК)


NM_003100 NM_001278199


NM_026386 NM_001357463

RefSeq (білок)


NP_001265128 NP_003091


NP_080662 NP_001344392

Локус (UCSC)

Хр. 5: 122.78 – 122.83 Mb

Хр. 18: 53.31 – 53.35 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNX2 (англ. Sorting nexin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 519 амінокислот, а молекулярна маса — 58 471^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAEREPPPL	GDGKPTDFED	LEDGEDLFTS	TVSTLESSPS	SPEPASLPAE
DISANSNGPK	PTEVVLDDDR	EDLFAEATEE	VSLDSPEREP	ILSSEPSPAV
TPVTPTTLIA	PRIESKSMSA	PVIFDRSREE	IEEEANGDIF	DIEIGVSDPE
KVGDGMNAYM	AYRVTTKTSL	SMFSKSEFSV	KRRFSDFLGL	HSKLASKYLH
VGYIVPPAPE	KSIVGMTKVK	VGKEDSSSTE	FVEKRRAALE	RYLQRTVKHP
TLLQDPDLRQ	FLESSELPRA	VNTQALSGAG	ILRMVNKAAD	AVNKMTIKMN
ESDAWFEEKQ	QQFENLDQQL	RKLHVSVEAL	VCHRKELSAN	TAAFAKSAAM
LGNSEDHTAL	SRALSQLAEV	EEKIDQLHQE	QAFADFYMFS	ELLSDYIRLI
AAVKGVFDHR	MKCWQKWEDA	QITLLKKREA	EAKMMVANKP	DKIQQAKNEI
REWEAKVQQG	ERDFEQISKT	IRKEVGRFEK	ERVKDFKTVI	IKYLESLVQT
QQQLIKYWEA	FLPEAKAIA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у мембрані, клітинних відростках, ендосомах.

Література

Haft C.R., de la Luz Sierra M., Barr V.A., Haft D.H., Taylor S.I. (1998). Identification of a family of sorting nexin molecules and characterization of their association with receptors. Mol. Cell. Biol. 18: 7278—7287. PMID 9819414 DOI:10.1128/MCB.18.12.7278
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Fuchs U., Rehkamp G.F., Slany R., Follo M., Borkhardt A. (2003). The formin-binding protein 17, FBP17, binds via a TNKS binding motif to tankyrase, a protein involved in telomere maintenance. FEBS Lett. 554: 10—16. PMID 14596906 DOI:10.1016/S0014-5793(03)01063-9
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Rojas R., Kametaka S., Haft C.R., Bonifacino J.S. (2007). Interchangeable but essential functions of SNX1 and SNX2 in the association of retromer with endosomes and the trafficking of mannose 6-phosphate receptors. Mol. Cell. Biol. 27: 1112—1124. PMID 17101778 DOI:10.1128/MCB.00156-06
Lieu Z.Z., Gleeson P.A. (2010). Identification of different itineraries and retromer components for endosome-to-Golgi transport of TGN38 and Shiga toxin. Eur. J. Cell Biol. 89: 379—393. PMID 20138391 DOI:10.1016/j.ejcb.2009.10.021

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11173 (англ.) . Архів оригіналу за 5 липня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, O60749 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.