SNRPB

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1D3B, 3CW1, 3PGW, 4PJO, 4WZJ, 3JCR

Ідентифікатори

Символи

SNRPB, COD, SNRPB1, Sm-B/B', SmB/B', SmB/SmB', snRNP-B, CCMS, small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1

Зовнішні ІД

OMIM: 182282 MGI: 98342 HomoloGene: 134543 GeneCards: SNRPB

Пов'язані генетичні захворювання

cerebro-costo-mandibular syndrome^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• histone pre-mRNA DCP binding • U2 snRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • telomerase RNA binding • RNA binding • U1 snRNP binding • U2 snRNP binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • SMN-Sm protein complex • гіалоплазма • catalytic step 2 spliceosome • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • histone pre-mRNA 3'end processing complex • U5 snRNP • U12-type spliceosomal complex • U2 snRNP • U1 snRNP • methylosome • U7 snRNP • small nuclear ribonucleoprotein complex • telomerase holoenzyme complex • spliceosomal complex • U4 snRNP • екзосома • U2-type prespliceosome • клітинне ядро • нуклеоплазма • U2-type precatalytic spliceosome • U2-type catalytic step 2 spliceosome
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • spliceosomal snRNP assembly • Сплайсинг РНК • histone mRNA metabolic process • Метилювання білків • import into nucleus • brain development
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6628


20638

Ensembl


ENSG00000125835


ENSMUSG00000027404

UniProt


P14678


P27048

RefSeq (мРНК)


NM_198216 NM_003091


NM_009225

RefSeq (білок)


NP_003082 NP_937859


NP_033251

Локус (UCSC)

Хр. 20: 2.46 – 2.47 Mb

Хр. 2: 130.01 – 130.02 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNRPB (англ. Small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 240 амінокислот, а молекулярна маса — 24 610^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTVGKSSKML	QHIDYRMRCI	LQDGRIFIGT	FKAFDKHMNL	ILCDCDEFRK
IKPKNSKQAE	REEKRVLGLV	LLRGENLVSM	TVEGPPPKDT	GIARVPLAGA
AGGPGIGRAA	GRGIPAGVPM	PQAPAGLAGP	VRGVGGPSQQ	VMTPQGRGTV
AAAAAAATAS	IAGAPTQYPP	GRGGPPPPMG	RGAPPPGMMG	PPPGMRPPMG
PPMGIPPGRG	TPMGMPPPGM	RPPPPGMRGP	PPPGMRPPRP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Schmauss C., McAllister G., Ohosone Y., Hardin J.A., Lerner M.R. (1989). A comparison of snRNP-associated Sm-autoantigens: human N, rat N and human B/B'. Nucleic Acids Res. 17: 1733—1743. PMID 2522186 DOI:10.1093/nar/17.4.1733
Chu J.-L., Elkon K.B. (1991). The small nuclear ribonucleoproteins, SmB and B', are products of a single gene. Gene. 97: 311—312. PMID 1825643 DOI:10.1016/0378-1119(91)90069-N
Pillai R.S., Will C.L., Luehrmann R., Schuemperli D., Mueller B. (2001). Purified U7 snRNPs lack the Sm proteins D1 and D2 but contain Lsm10, a new 14 kDa Sm D1-like protein. EMBO J. 20: 5470—5479. PMID 11574479 DOI:10.1093/emboj/20.19.5470
Narayanan U., Ospina J.K., Frey M.R., Hebert M.D., Matera A.G. (2002). SMN, the spinal muscular atrophy protein, forms a pre-import snRNP complex with snurportin1 and importin beta. Hum. Mol. Genet. 11: 1785—1795. PMID 12095920 DOI:10.1093/hmg/11.15.1785
Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
Cote J., Richard S. (2005). Tudor domains bind symmetrical dimethylated arginines. J. Biol. Chem. 280: 28476—28483. PMID 15955813 DOI:10.1074/jbc.M414328200

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SNRPB переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11153 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P14678 (англ.) . Архів оригіналу за 7 березня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.