SMC4 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SMC4, CAP-C, CAPC, SMC-4, SMC4L1, hCAP-C, structural maintenance of chromosomes 4 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605575 MGI: 1917349 HomoloGene: 4015 GeneCards: SMC4 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein heterodimerization activity • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • single-stranded DNA binding |
---|
Клітинна компонента | • хромосома • клітинне ядро • Конденсин • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма • nuclear speck |
---|
Біологічний процес | • mitotic sister chromatid segregation • meiotic chromosome segregation • поділ клітини • клітинний цикл • kinetochore organization • mitotic chromosome condensation • meiotic chromosome condensation • chromosome condensation • GO:0051312, GO:0007083 chromosome organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001002799 NM_001002800 NM_001288753 NM_005496 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001002800 NP_001275682 NP_005487 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 160.4 – 160.43 Mb | Хр. 3: 68.91 – 68.94 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SMC4 (англ. Structural maintenance of chromosomes 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 288 амінокислот, а молекулярна маса — 147 182[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPRKGTQPST | | ARRREEGPPP | | PSPDGASSDA | | EPEPPSGRTE | | SPATAAETAS |
EELDNRSLEE | | ILNSIPPPPP | | PAMTNEAGAP | | RLMITHIVNQ | | NFKSYAGEKI |
LGPFHKRFSC | | IIGPNGSGKS | | NVIDSMLFVF | | GYRAQKIRSK | | KLSVLIHNSD |
EHKDIQSCTV | | EVHFQKIIDK | | EGDDYEVIPN | | SNFYVSRTAC | | RDNTSVYHIS |
GKKKTFKDVG | | NLLRSHGIDL | | DHNRFLILQG | | EVEQIAMMKP | | KGQTEHDEGM |
LEYLEDIIGC | | GRLNEPIKVL | | CRRVEILNEH | | RGEKLNRVKM | | VEKEKDALEG |
EKNIAIEFLT | | LENEIFRKKN | | HVCQYYIYEL | | QKRIAEMETQ | | KEKIHEDTKE |
INEKSNILSN | | EMKAKNKDVK | | DTEKKLNKIT | | KFIEENKEKF | | TQLDLEDVQV |
REKLKHATSK | | AKKLEKQLQK | | DKEKVEEFKS | | IPAKSNNIIN | | ETTTRNNALE |
KEKEKEEKKL | | KEVMDSLKQE | | TQGLQKEKES | | REKELMGFSK | | SVNEARSKMD |
VAQSELDIYL | | SRHNTAVSQL | | TKAKEALIAA | | SETLKERKAA | | IRDIEGKLPQ |
TEQELKEKEK | | ELQKLTQEET | | NFKSLVHDLF | | QKVEEAKSSL | | AMNRSRGKVL |
DAIIQEKKSG | | RIPGIYGRLG | | DLGAIDEKYD | | VAISSCCHAL | | DYIVVDSIDI |
AQECVNFLKR | | QNIGVATFIG | | LDKMAVWAKK | | MTEIQTPENT | | PRLFDLVKVK |
DEKIRQAFYF | | ALRDTLVADN | | LDQATRVAYQ | | KDRRWRVVTL | | QGQIIEQSGT |
MTGGGSKVMK | | GRMGSSLVIE | | ISEEEVNKME | | SQLQNDSKKA | | MQIQEQKVQL |
EERVVKLRHS | | EREMRNTLEK | | FTASIQRLIE | | QEEYLNVQVK | | ELEANVLATA |
PDKKKQKLLE | | ENVSAFKTEY | | DAVAEKAGKV | | EAEVKRLHNT | | IVEINNHKLK |
AQQDKLDKIN | | KQLDECASAI | | TKAQVAIKTA | | DRNLQKAQDS | | VLRTEKEIKD |
TEKEVDDLTA | | ELKSLEDKAA | | EVVKNTNAAE | | ESLPEIQKEH | | RNLLQELKVI |
QENEHALQKD | | ALSIKLKLEQ | | IDGHIAEHNS | | KIKYWHKEIS | | KISLHPIEDN |
PIEEISVLSP | | EDLEAIKNPD | | SITNQIALLE | | ARCHEMKPNL | | GAIAEYKKKE |
ELYLQRVAEL | | DKITYERDSF | | RQAYEDLRKQ | | RLNEFMAGFY | | IITNKLKENY |
QMLTLGGDAE | | LELVDSLDPF | | SEGIMFSVRP | | PKKSWKKIFN | | LSGGEKTLSS |
LALVFALHHY | | KPTPLYFMDE | | IDAALDFKNV | | SIVAFYIYEQ | | TKNAQFIIIS |
LRNNMFEISD | | RLIGIYKTYN | | ITKSVAVNPK | | EIASKGLC |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, конденсація ДНК, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.
Література
- Schmiesing J.A., Gregson H.C., Zhou S., Yokomori K. (2000). A human condensin complex containing hCAP-C-hCAP-E and CNAP1, a homolog of Xenopus XCAP-D2, colocalizes with phosphorylated histone H3 during the early stage of mitotic chromosome condensation. Mol. Cell. Biol. 20: 6996—7006. PMID 10958694 DOI:10.1128/MCB.20.18.6996-7006.2000
- Kimura K., Cuvier O., Hirano T. (2001). Chromosome condensation by a human condensin complex in Xenopus egg extracts. J. Biol. Chem. 276: 5417—5420. PMID 11136719 DOI:10.1074/jbc.C000873200
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14013 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NTJ3 (англ.) . Архів оригіналу за 26 лютого 2018. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |