SMC1B |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SMC1B, SMC1BETA, SMC1L2, structural maintenance of chromosomes 1B |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608685 MGI: 2154049 HomoloGene: 13786 GeneCards: SMC1B |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • nucleotide binding • ATP binding |
---|
Клітинна компонента | • lateral element • condensed nuclear chromosome • synaptonemal complex • центромера • клітинне ядро • нуклеоплазма • хромосома • GO:0034991 meiotic cohesin complex • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • клітинний цикл • GO:0007126 мейоз • GO:0051312, GO:0007083 chromosome organization • sister chromatid cohesion |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 22: 45.34 – 45.41 Mb | Хр. 15: 84.95 – 85.02 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SMC1B (англ. Structural maintenance of chromosomes 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 235 амінокислот, а молекулярна маса — 143 908[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAHLELLLVE | | NFKSWRGRQV | | IGPFRRFTCI | | IGPNGSGKSN | | VMDALSFVMG |
EKIANLRVKN | | IQELIHGAHI | | GKPISSSASV | | KIIYVEESGE | | EKTFARIIRG |
GCSEFRFNDN | | LVSRSVYIAE | | LEKIGIIVKA | | QNCLVFQGTV | | ESISVKKPKE |
RTQFFEEIST | | SGELIGEYEE | | KKRKLQKAEE | | DAQFNFNKKK | | NIAAERRQAK |
LEKEEAERYQ | | SLLEELKMNK | | IQLQLFQLYH | | NEKKIHLLNT | | KLEHVNRDLS |
VKRESLSHHE | | NIVKARKKEH | | GMLTRQLQQT | | EKELKSVETL | | LNQKRPQYIK |
AKENTSHHLK | | KLDVAKKSIK | | DSEKQCSKQE | | DDIKALETEL | | ADLDAAWRSF |
EKQIEEEILH | | KKRDIELEAS | | QLDRYKELKE | | QVRKKVATMT | | QQLEKLQWEQ |
KTDEERLAFE | | KRRHGEVQGN | | LKQIKEQIED | | HKKRIEKLEE | | YTKTCMDCLK |
EKKQQEETLV | | DEIEKTKSRM | | SEFNEELNLI | | RSELQNAGID | | THEGKRQQKR |
AEVLEHLKRL | | YPDSVFGRLF | | DLCHPIHKKY | | QLAVTKVFGR | | FITAIVVASE |
KVAKDCIRFL | | KEERAEPETF | | LALDYLDIKP | | INERLRELKG | | CKMVIDVIKT |
QFPQLKKVIQ | | FVCGNGLVCE | | TMEEARHIAL | | SGPERQKTVA | | LDGTLFLKSG |
VISGGSSDLK | | YKARCWDEKE | | LKNLRDRRSQ | | KIQELKGLMK | | TLRKETDLKQ |
IQTLIQGTQT | | RLKYSQNELE | | MIKKKHLVAF | | YQEQSQLQSE | | LLNIESQCIM |
LSEGIKERQR | | RIKEFQEKID | | KVEDDIFQHF | | CEEIGVENIR | | EFENKHVKRQ |
QEIDQKRYFY | | KKMLTRLNVQ | | LEYSRSHLKK | | KLNKINTLKE | | TIQKGSEDID |
HLKKAEENCL | | QTVNELMAKQ | | QQLKDIRVTQ | | NSSAEKVQTQ | | IEEERKKFLA |
VDREVGKLQK | | EVVSIQTSLE | | QKRLEKHNLL | | LDCKVQDIEI | | ILLSGSLDDI |
IEVEMGTEAE | | STQATIDIYE | | KEEAFEIDYS | | SLKEDLKALQ | | SDQEIEAHLR |
LLLQQVASQE | | DILLKTAAPN | | LRALENLKTV | | RDKFQESTDA | | FEASRKEARL |
CRQEFEQVKK | | RRYDLFTQCF | | EHVSISIDQI | | YKKLCRNNSA | | QAFLSPENPE |
EPYLEGISYN | | CVAPGKRFMP | | MDNLSGGEKC | | VAALALLFAV | | HSFRPAPFFV |
LDEVDAALDN | | TNIGKVSSYI | | KEQTQDQFQM | | IVISLKEEFY | | SRADALIGIY |
PEYDDCMFSR | | VLTLDLSQYP | | DTEGQESSKR | | HGESR |
Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, мейоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.
Література
- Cobbe N., Heck M.M.S. (2004). The evolution of SMC proteins: phylogenetic analysis and structural implications. Mol. Biol. Evol. 21: 332—347. PMID 14660695 DOI:10.1093/molbev/msh023
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11112 (англ.) . Архів оригіналу за 1 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8NDV3 (англ.) . Архів оригіналу за 30 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |