SLC26A6

SLC26A6
Ідентифікатори
Символи SLC26A6, solute carrier family 26 member 6
Зовнішні ІД OMIM: 610068 MGI: 2159728 HomoloGene: 99903 GeneCards: SLC26A6
Онтологія гена
Молекулярна функція

• PDZ domain binding
• GO:0015659 formate transmembrane transporter activity
• chloride transmembrane transporter activity
• anion transmembrane transporter activity
• sulfate transmembrane transporter activity
• secondary active sulfate transmembrane transporter activity
• bicarbonate transmembrane transporter activity
• formate efflux transmembrane transporter activity
• oxalate transmembrane transporter activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• efflux transmembrane transporter activity
• antiporter activity
• chloride channel activity
• inorganic anion exchanger activity

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• мембрана
• внутрішньоклітинна мембранна органела
• vesicle membrane
• клітинна мембрана
• integral component of plasma membrane
• chloride channel complex
• brush border membrane
• basolateral plasma membrane
• apical plasma membrane
• ендоплазматичний ретикулум
• sperm midpiece
• cytoplasmic vesicle membrane
• GO:0016023 cytoplasmic vesicle
• внутрішньоклітинний
• везикула

Біологічний процес

• oxalic acid secretion
• mannitol transport
• oxalate transport
• formate transport
• intracellular pH elevation
• sulfate transport
• epithelial fluid transport
• angiotensin-activated signaling pathway
• regulation of membrane potential
• regulation of intracellular pH
• cellular response to fructose stimulus
• ion transport
• transepithelial chloride transport
• protein kinase C signaling
• anion transport
• transepithelial transport
• cellular response to interferon-gamma
• sperm capacitation
• intestinal absorption
• chloride transport
• positive regulation of dipeptide transmembrane transport
• cellular response to cAMP
• anion transmembrane transport
• sulfate transmembrane transport
• bicarbonate transport
• трансмембранний транспорт
• chloride transmembrane transport

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
65010
171429
Ensembl
ENSG00000225697
ENSMUSG00000023259
UniProt
Q9BXS9
Q8CIW6
RefSeq (мРНК)
NM_134426
NM_001040454
NM_001281732
NM_001281733
NM_022911
NM_134263
NM_134420
RefSeq (білок)
NP_001035544
NP_001268661
NP_001268662
NP_075062
NP_599025
NP_602298
NP_001035544.1
NP_599252
NP_001395316
Локус (UCSC) Хр. 3: 48.63 – 48.64 Mb Хр. 9: 108.73 – 108.74 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SLC26A6 (англ. Solute carrier family 26 member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 759 амінокислот, а молекулярна маса — 82 967[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGLADASGPRDTQALLSATQAMDLRRRDYHMERPLLNQEHLEELGRWGSA
PRTHQWRTWLQCSRARAYALLLQHLPVLVWLPRYPVRDWLLGDLLSGLSV
AIMQLPQGLAYALLAGLPPVFGLYSSFYPVFIYFLFGTSRHISVGTFAVM
SVMVGSVTESLAPQALNDSMINETARDAARVQVASTLSVLVGLFQVGLGL
IHFGFVVTYLSEPLVRGYTTAAAVQVFVSQLKYVFGLHLSSHSGPLSLIY
TVLEVCWKLPQSKVGTVVTAAVAGVVLVVVKLLNDKLQQQLPMPIPGELL
TLIGATGISYGMGLKHRFEVDVVGNIPAGLVPPVAPNTQLFSKLVGSAFT
IAVVGFAIAISLGKIFALRHGYRVDSNQELVALGLSNLIGGIFQCFPVSC
SMSRSLVQESTGGNSQVAGAISSLFILLIIVKLGELFHDLPKAVLAAIII
VNLKGMLRQLSDMRSLWKANRADLLIWLVTFTATILLNLDLGLVVAVIFS
LLLVVVRTQMPHYSVLGQVPDTDIYRDVAEYSEAKEVRGVKVFRSSATVY
FANAEFYSDALKQRCGVDVDFLISQKKKLLKKQEQLKLKQLQKEEKLRKQ
AASPKGASVSINVNTSLEDMRSNNVEDCKMMQVSSGDKMEDATANGQEDS
KAPDGSTLKALGLPQPDFHSLILDLGALSFVDTVCLKSLKNIFHDFREIE
VEVYMAACHSPVVSQLEAGHFFDASITKKHLFASVHDAVTFALQHPRPVP
DSPVSVTRL

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, хлорних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, мікросомах.

Література

  • Xie Q., Welch R., Mercado A., Romero M.F., Mount D.B. (2002). Molecular characterization of the murine Slc26a6 anion exchanger: functional comparison with Slc26a1. Am. J. Physiol. 283: F826—F838. PMID 12217875 DOI:10.1152/ajprenal.00079.2002
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Alvarez B.V., Vilas G.L., Casey J.R. (2005). Metabolon disruption: a mechanism that regulates bicarbonate transport. EMBO J. 24: 2499—2511. PMID 15990874 DOI:10.1038/sj.emboj.7600736
  • Freel R.W., Morozumi M., Hatch M. (2009). Parsing apical oxalate exchange in Caco-2BBe1 monolayers: siRNA knockdown of SLC26A6 reveals the role and properties of PAT-1. Am. J. Physiol. 297: G918—G929. PMID 20501439 DOI:10.1152/ajpgi.00251.2009

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14472 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
  4. ↑ UniProt, Q9BXS9 (англ.) . Архів оригіналу за 31 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 3
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.