SKIL

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3EQ5

Ідентифікатори

Символи

SKIL, SNO, SnoA, SnoI, SnoN, SKI-like proto-oncogene, SKI like proto-oncogene

Зовнішні ІД

OMIM: 165340 MGI: 106203 HomoloGene: 3948 GeneCards: SKIL

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • protein domain specific binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • SMAD binding • chromatin binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0032403 protein-containing complex binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • PML body • нуклеоплазма • Акросома • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • response to cytokine • lymphocyte homeostasis • GO:1904576 response to antibiotic • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • blastocyst formation • positive regulation of axonogenesis • protein homotrimerization • lens fiber cell differentiation • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • Сперматогенез • protein heterotrimerization • response to growth factor • skeletal muscle tissue development • negative regulation of BMP signaling pathway • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • neuron development • negative regulation of cell differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6498


20482

Ensembl


ENSG00000136603


ENSMUSG00000027660

UniProt


P12757


Q60665

RefSeq (мРНК)


NM_001145097 NM_001145098 NM_001248008 NM_005414

NM_001039090 NM_001271772 NM_011386 NM_001398558 NM_001398559
NM_001398560

RefSeq (білок)


NP_001138569 NP_001138570 NP_001234937 NP_005405

NP_001034179 NP_001258701 NP_035516 NP_001385487 NP_001385488
NP_001385489

Локус (UCSC)

Хр. 3: 170.36 – 170.4 Mb

Хр. 3: 31.15 – 31.18 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SKIL (англ. SKI like proto-oncogene) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 684 амінокислот, а молекулярна маса — 76 976^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MENLQTNFSL	VQGSTKKLNG	MGDDGSPPAK	KMITDIHANG	KTINKVPTVK
KEHLDDYGEA	PVETDGEHVK	RTCTSVPETL	HLNPSLKHTL	AQFHLSSQSS
LGGPAAFSAR	HSQESMSPTV	FLPLPSPQVL	PGPLLIPSDS	STELTQTVLE
GESISCFQVG	GEKRLCLPQV	LNSVLREFTL	QQINTVCDEL	YIYCSRCTSD
QLHILKVLGI	LPFNAPSCGL	ITLTDAQRLC	NALLRPRTFP	QNGSVLPAKS
SLAQLKETGS	AFEVEHECLG	KCQGLFAPQF	YVQPDAPCIQ	CLECCGMFAP
QTFVMHSHRS	PDKRTCHWGF	ESAKWHCYLH	VNQKYLGTPE	EKKLKIILEE
MKEKFSMRSG	KRNQSKTDAP	SGMELQSWYP	VIKQEGDHVS	QTHSFLHPSY
YLYMCDKVVA	PNVSLTSAVS	QSKELTKTEA	SKSISRQSEK	AHSSGKLQKT
VSYPDVSLEE	QEKMDLKTSR	ELCSRLDASI	SNNSTSKRKS	ESATCNLVRD
INKVGIGLVA	AASSPLLVKD	VICEDDKGKI	MEEVMRTYLK	QQEKLNLILQ
KKQQLQMEVK	MLSSSKSMKE	LTEEQQNLQK	ELESLQNEHA	QRMEEFYVEQ
KDLEKKLEQI	MKQKCTCDSN	LEKDKEAEYA	GQLAELRQRL	DHAEADRQEL
QDELRQEREA	RQKLEMMIKE	LKLQILKSSK	TAKE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг.

Література

Pearson-White S.H., Crittenden R. (1997). Proto-oncogene Sno expression, alternative isoforms and immediate early serum response. Nucleic Acids Res. 25: 2930—2937. PMID 9207045 DOI:10.1093/nar/25.14.2930
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Pearson-White S. (1993). SnoI, a novel alternatively spliced isoform of the ski proto-oncogene homolog, sno. Nucleic Acids Res. 21: 4632—4638. PMID 8233802 DOI:10.1093/nar/21.19.4632

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10897 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, P12757 (англ.) . Архів оригіналу за 25 лютого 2018. Процитовано 30 серпня 2017.