SIDT1

Ідентифікатори

Символи

SIDT1, B830021E24Rik, SID-1, SID1, SID1 transmembrane family member 1

Зовнішні ІД

OMIM: 606816 MGI: 2443155 HomoloGene: 41189 GeneCards: SIDT1

Пов'язані генетичні захворювання

Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA transmembrane transporter activity • RNA binding • double-stranded RNA binding
Клітинна компонента	• мембрана • integral component of membrane • лізосома • клітинна мембрана
Біологічний процес	• dsRNA transport • RNA transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


54847


320007

Ensembl


ENSG00000072858


ENSMUSG00000022696

UniProt


Q9NXL6


Q6AXF6

RefSeq (мРНК)

NM_001308350 NM_017699 NM_001322294 NM_001322295 NM_001322296
NM_001322297 NM_001322298 NM_001322299 NM_001322300


NM_001159419 NM_198034

RefSeq (білок)

NP_001295279 NP_001309223 NP_001309224 NP_001309225 NP_001309226
NP_001309227 NP_001309228 NP_001309229 NP_060169


NP_001152891 NP_932151

Локус (UCSC)

Хр. 3: 113.53 – 113.63 Mb

Хр. 16: 44.06 – 44.15 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SIDT1 (англ. SID1 transmembrane family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 827 амінокислот, а молекулярна маса — 93 839^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRGCLRLALL	CALPWLLLAA	SPGHPAKSPR	QPPAPRRDPF	DAARGADFDH
VYSGVVNLST	ENIYSFNYTS	QPDQVTAVRV	YVNSSSENLN	YPVLVVVRQQ
KEVLSWQVPL	LFQGLYQRSY	NYQEVSRTLC	PSEATNETGP	LQQLIFVDVA
SMAPLGAQYK	LLVTKLKHFQ	LRTNVAFHFT	ASPSQPQYFL	YKFPKDVDSV
IIKVVSEMAY	PCSVVSVQNI	MCPVYDLDHN	VEFNGVYQSM	TKKAAITLQK
KDFPGEQFFV	VFVIKPEDYA	CGGSFFIQEK	ENQTWNLQRK	KNLEVTIVPS
IKESVYVKSS	LFSVFIFLSF	YLGCLLVGFV	HYLRFQRKSI	DGSFGSNDGS
GNMVASHPIA	ASTPEGSNYG	TIDESSSSPG	RQMSSSDGGP	PGQSDTDSSV
EESDFDTMPD	IESDKNIIRT	KMFLYLSDLS	RKDRRIVSKK	YKIYFWNIIT
IAVFYALPVI	QLVITYQTVV	NVTGNQDICY	YNFLCAHPLG	VLSAFNNILS
NLGHVLLGFL	FLLIVLRRDI	LHRRALEAKD	IFAVEYGIPK	HFGLFYAMGI
ALMMEGVLSA	CYHVCPNYSN	FQFDTSFMYM	IAGLCMLKLY	QTRHPDINAS
AYSAYASFAV	VIMVTVLGVV	FGKNDVWFWV	IFSAIHVLAS	LALSTQIYYM
GRFKIDLGIF	RRAAMVFYTD	CIQQCSRPLY	MDRMVLLVVG	NLVNWSFALF
GLIYRPRDFA	SYMLGIFICN	LLLYLAFYII	MKLRSSEKVL	PVPLFCIVAT
AVMWAAALYF	FFQNLSSWEG	TPAESREKNR	ECILLDFFDD	HDIWHFLSAT
ALFFSFLVLL	TLDDDLDVVR	RDQIPVF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SIDT1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25967 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NXL6 (англ.) . Архів оригіналу за 24 лютого 2018. Процитовано 18 вересня 2017.