SETD6 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3QXY, 3RC0 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SETD6, SET domain containing 6, SET domain containing 6, protein lysine methyltransferase |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 616424 MGI: 1913333 HomoloGene: 38743 GeneCards: SETD6 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • NF-kappaB binding • protein-lysine N-methyltransferase activity |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • stem cell population maintenance • histone lysine methylation • Метилювання • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • peptidyl-lysine monomethylation • stem cell differentiation • regulation of inflammatory response |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 58.52 – 58.52 Mb | Хр. 8: 95.72 – 95.72 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SETD6 (англ. SET domain containing 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 473 амінокислот, а молекулярна маса — 53 189[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MATQAKRPRV | | AGPVDGGDLD | | PVACFLSWCR | | RVGLELSPKV | | SERAGGRRTR |
GGARAALTSP | | PAQVAVSRQG | | TVAGYGMVAR | | ESVQAGELLF | | VVPRAALLSQ |
HTCSIGGLLE | | RERVALQSQS | | GWVPLLLALL | | HELQAPASRW | | RPYFALWPEL |
GRLEHPMFWP | | EEERRCLLQG | | TGVPEAVEKD | | LANIRSEYQS | | IVLPFMEAHP |
DLFSLRVRSL | | ELYHQLVALV | | MAYSFQEPLE | | EEEDEKEPNS | | PVMVPAADIL |
NHLANHNANL | | EYSANCLRMV | | ATQPIPKGHE | | IFNTYGQMAN | | WQLIHMYGFV |
EPYPDNTDDT | | ADIQMVTVRE | | AALQGTKTEA | | ERHLVYERWD | | FLCKLEMVGE |
EGAFVIGREE | | VLTEEELTTT | | LKVLCMPAEE | | FRELKDQDGG | | GDDKREEGSL |
TITNIPKLKA | | SWRQLLQNSV | | LLTLQTYATD | | LKTDQGLLSN | | KEVYAKLSWR |
EQQALQVRYG | | QKMILHQLLE | | LTS |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26116 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q8TBK2 (англ.) . Архів оригіналу за 29 грудня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |