SEMA4C

Ідентифікатори

Символи

SEMA4C, M-SEMA-F, SEMACL1, SEMAF, SEMAI, semaphorin 4C

Зовнішні ІД

OMIM: 604462 MGI: 109252 HomoloGene: 23047 GeneCards: SEMA4C

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • neuropilin binding • semaphorin receptor binding • chemorepellent activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • postsynaptic membrane • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • клітинна мембрана • синапс • synaptic vesicle membrane • міжклітинні контакти • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • міжклітинний простір • мембрана • integral component of plasma membrane
Біологічний процес	• диференціація клітин • cell migration in hindbrain • cerebellum development • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • muscle cell differentiation • neural tube closure • positive regulation of stress-activated MAPK cascade • semaphorin-plexin signaling pathway • negative chemotaxis • neural crest cell migration • positive regulation of cell migration • negative regulation of axon extension involved in axon guidance
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


54910


20353

Ensembl


ENSG00000168758


ENSMUSG00000026121

UniProt


Q9C0C4


Q64151

RefSeq (мРНК)


NM_017789


NM_001126047 NM_001304329 NM_001304330

RefSeq (білок)


NP_060259


NP_001119519 NP_001291258 NP_001291259

Локус (UCSC)

Хр. 2: 96.86 – 96.87 Mb

Хр. 1: 36.59 – 36.6 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SEMA4C (англ. Semaphorin 4C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 833 амінокислот, а молекулярна маса — 92 623^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPHWAVWLL	AARLWGLGIG	AEVWWNLVPR	KTVSSGELAT	VVRRFSQTGI
QDFLTLTLTE	PTGLLYVGAR	EALFAFSMEA	LELQGAISWE	APVEKKTECI
QKGKNNQTEC	FNFIRFLQPY	NASHLYVCGT	YAFQPKCTYV	NMLTFTLEHG
EFEDGKGKCP	YDPAKGHAGL	LVDGELYSAT	LNNFLGTEPI	ILRNMGPHHS
MKTEYLAFWL	NEPHFVGSAY	VPESVGSFTG	DDDKVYFFFR	ERAVESDCYA
EQVVARVARV	CKGDMGGART	LQRKWTTFLK	ARLACSAPNW	QLYFNQLQAM
HTLQDTSWHN	TTFFGVFQAQ	WGDMYLSAIC	EYQLEEIQRV	FEGPYKEYHE
EAQKWDRYTD	PVPSPRPGSC	INNWHRRHGY	TSSLELPDNI	LNFVKKHPLM
EEQVGPRWSR	PLLVKKGTNF	THLVADRVTG	LDGATYTVLF	IGTGDGWLLK
AVSLGPWVHL	IEELQLFDQE	PMRSLVLSQS	KKLLFAGSRS	QLVQLPVADC
MKYRSCADCV	LARDPYCAWS	VNTSRCVAVG	GHSGSLLIQH	VMTSDTSGIC
NLRGSKKVRP	TPKNITVVAG	TDLVLPCHLS	SNLAHARWTF	GGRDLPAEQP
GSFLYDARLQ	ALVVMAAQPR	HAGAYHCFSE	EQGARLAAEG	YLVAVVAGPS
VTLEARAPLE	NLGLVWLAVV	ALGAVCLVLL	LLVLSLRRRL	REELEKGAKA
TERTLVYPLE	LPKEPTSPPF	RPCPEPDEKL	WDPVGYYYSD	GSLKIVPGHA
RCQPGGGPPS	PPPGIPGQPL	PSPTRLHLGG	GRNSNANGYV	RLQLGGEDRG
GLGHPLPELA	DELRRKLQQR	QPLPDSNPEE	SSV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, нейрогенез. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10731 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9C0C4 (англ.) . Архів оригіналу за 5 травня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.