SEMA3F

Ідентифікатори

Символи

SEMA3F, SEMA-IV, SEMA4, SEMAK, semaphorin 3F

Зовнішні ІД

OMIM: 601124 MGI: 1096347 HomoloGene: 20885 GeneCards: SEMA3F

Онтологія гена
Молекулярна функція	• chemorepellent activity • neuropilin binding • semaphorin receptor binding
Клітинна компонента	• extracellular region • міжклітинний простір • glutamatergic synapse • integral component of plasma membrane
Біологічний процес	• sympathetic ganglion development • ventral trunk neural crest cell migration • semaphorin-plexin signaling pathway involved in neuron projection guidance • negative chemotaxis • semaphorin-plexin signaling pathway involved in axon guidance • axon guidance • sympathetic neuron projection guidance • neural crest cell migration involved in autonomic nervous system development • branchiomotor neuron axon guidance • facial nerve structural organization • nerve development • sympathetic neuron projection extension • trigeminal nerve structural organization • axon extension involved in axon guidance • neural crest cell migration • negative regulation of axon extension involved in axon guidance • regulation of postsynapse organization • positive regulation of cell migration • semaphorin-plexin signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6405


20350

Ensembl


ENSG00000001617


ENSMUSG00000034684

UniProt


Q13275


O88632

RefSeq (мРНК)


NM_004186 NM_001318798 NM_001318800


NM_011349 NM_001311151 NM_001379496

RefSeq (білок)


NP_001305727 NP_001305729 NP_004177

NP_001298080 NP_035479 NP_001366425 NP_001391952 NP_001391953
NP_001391954

Локус (UCSC)

Хр. 3: 50.16 – 50.19 Mb

Хр. 9: 107.56 – 107.59 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SEMA3F (англ. Semaphorin 3F) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 785 амінокислот, а молекулярна маса — 88 381^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLVAGLLLWA	SLLTGAWPSF	PTQDHLPATP	RVRLSFKELK	ATGTAHFFNF
LLNTTDYRIL	LKDEDHDRMY	VGSKDYVLSL	DLHDINREPL	IIHWAASPQR
IEECVLSGKD	VNGECGNFVR	LIQPWNRTHL	YVCGTGAYNP	MCTYVNRGRR
AQATPWTQTQ	AVRGRGSRAT	DGALRPMPTA	PRQDYIFYLE	PERLESGKGK
CPYDPKLDTA	SALINEELYA	GVYIDFMGTD	AAIFRTLGKQ	TAMRTDQYNS
RWLNDPSFIH	AELIPDSAER	NDDKLYFFFR	ERSAEAPQSP	AVYARIGRIC
LNDDGGHCCL	VNKWSTFLKA	RLVCSVPGED	GIETHFDELQ	DVFVQQTQDV
RNPVIYAVFT	SSGSVFRGSA	VCVYSMADIR	MVFNGPFAHK	EGPNYQWMPF
SGKMPYPRPG	TCPGGTFTPS	MKSTKDYPDE	VINFMRSHPL	MYQAVYPLQR
RPLVVRTGAP	YRLTTIAVDQ	VDAADGRYEV	LFLGTDRGTV	QKVIVLPKDD
QELEELMLEE	VEVFKDPAPV	KTMTISSKRQ	QLYVASAVGV	THLSLHRCQA
YGAACADCCL	ARDPYCAWDG	QACSRYTASS	KRRSRRQDVR	HGNPIRQCRG
FNSNANKNAV	ESVQYGVAGS	AAFLECQPRS	PQATVKWLFQ	RDPGDRRREI
RAEDRFLRTE	QGLLLRALQL	SDRGLYSCTA	TENNFKHVVT	RVQLHVLGRD
AVHAALFPPL	SMSAPPPPGA	GPPTPPYQEL	AQLLAQPEVG	LIHQYCQGYW
RHVPPSPREA	PGAPRSPEPQ	DQKKPRNRRH	HPPDT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10728 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q13275 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.