SEC31A |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SEC31A, ABP125, ABP130, HSPC334, SEC31L1, HSPC275, SEC31 homolog A, COPII coat complex component, NEDSOSB, HPBKS |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610257 MGI: 1916412 HomoloGene: 42056 GeneCards: SEC31A |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium-dependent protein binding • structural molecule activity |
---|
Клітинна компонента | • COPII-coated ER to Golgi transport vesicle • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • ER to Golgi transport vesicle membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • perinuclear region of cytoplasm • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • цитоплазма • endoplasmic reticulum exit site • endoplasmic reticulum membrane • vesicle coat • Golgi membrane • гіалоплазма • COPII vesicle coat |
---|
Біологічний процес | • IRE1-mediated unfolded protein response • response to calcium ion • COPII vesicle coating • vesicle-mediated transport • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • protein transport • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • COPII-coated vesicle cargo loading • intracellular protein transport • COPII-coated vesicle budding • endoplasmic reticulum organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001077206 NM_001077207 NM_001077208 NM_001191049 NM_001300744
| NM_001300745 NM_014933 NM_016211 NM_001318119 NM_001318120 |
| NM_026969 NM_001359323 NM_001359332 NM_001359344 NM_001359348
| NM_001359349 NM_001359350 NM_001400516 NM_001400517 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001070674 NP_001070675 NP_001070676 NP_001177978 NP_001287673
| NP_001287674 NP_001305048 NP_001305049 NP_057295 |
| NP_081245 NP_001346252 NP_001346261 NP_001346273 NP_001346277
| NP_001346278 NP_001346279 NP_001387445 NP_001387446 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 4: 82.82 – 82.9 Mb | Хр. 5: 100.51 – 100.56 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SEC31A (англ. SEC31 homolog A, COPII coat complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 220 амінокислот, а молекулярна маса — 133 015[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MKLKEVDRTA | | MQAWSPAQNH | | PIYLATGTSA | | QQLDATFSTN | | ASLEIFELDL |
SDPSLDMKSC | | ATFSSSHRYH | | KLIWGPYKMD | | SKGDVSGVLI | | AGGENGNIIL |
YDPSKIIAGD | | KEVVIAQNDK | | HTGPVRALDV | | NIFQTNLVAS | | GANESEIYIW |
DLNNFATPMT | | PGAKTQPPED | | ISCIAWNRQV | | QHILASASPS | | GRATVWDLRK |
NEPIIKVSDH | | SNRMHCSGLA | | WHPDVATQMV | | LASEDDRLPV | | IQMWDLRFAS |
SPLRVLENHA | | RGILAIAWSM | | ADPELLLSCG | | KDAKILCSNP | | NTGEVLYELP |
TNTQWCFDIQ | | WCPRNPAVLS | | AASFDGRISV | | YSIMGGSTDG | | LRQKQVDKLS |
SSFGNLDPFG | | TGQPLPPLQI | | PQQTAQHSIV | | LPLKKPPKWI | | RRPVGASFSF |
GGKLVTFENV | | RMPSHQGAEQ | | QQQQHHVFIS | | QVVTEKEFLS | | RSDQLQQAVQ |
SQGFINYCQK | | KIDASQTEFE | | KNVWSFLKVN | | FEDDSRGKYL | | ELLGYRKEDL |
GKKIALALNK | | VDGANVALKD | | SDQVAQSDGE | | ESPAAEEQLL | | GEHIKEEKEE |
SEFLPSSGGT | | FNISVSGDID | | GLITQALLTG | | NFESAVDLCL | | HDNRMADAII |
LAIAGGQELL | | ARTQKKYFAK | | SQSKITRLIT | | AVVMKNWKEI | | VESCDLKNWR |
EALAAVLTYA | | KPDEFSALCD | | LLGTRLENEG | | DSLLQTQACL | | CYICAGNVEK |
LVACWTKAQD | | GSHPLSLQDL | | IEKVVILRKA | | VQLTQAMDTS | | TVGVLLAAKM |
SQYANLLAAQ | | GSIAAALAFL | | PDNTNQPNIM | | QLRDRLCRAQ | | GEPVAGHESP |
KIPYEKQQLP | | KGRPGPVAGH | | HQMPRVQTQQ | | YYPHGENPPP | | PGFIMHGNVN |
PNAAGQLPTS | | PGHMHTQVPP | | YPQPQPYQPA | | QPYPFGTGGS | | AMYRPQQPVA |
PPTSNAYPNT | | PYISSASSYT | | GQSQLYAAQH | | QASSPTSSPA | | TSFPPPPSSG |
ASFQHGGPGA | | PPSSSAYALP | | PGTTGTLPAA | | SELPASQRTG | | PQNGWNDPPA |
LNRVPKKKKM | | PENFMPPVPI | | TSPIMNPLGD | | PQSQMLQQQP | | SAPVPLSSQS |
SFPQPHLPGG | | QPFHGVQQPL | | GQTGMPPSFS | | KPNIEGAPGA | | PIGNTFQHVQ |
SLPTKKITKK | | PIPDEHLILK | | TTFEDLIQRC | | LSSATDPQTK | | RKLDDASKRL |
EFLYDKLREQ | | TLSPTITSGL | | HNIARSIETR | | NYSEGLTMHT | | HIVSTSNFSE |
TSAFMPVLKV | | VLTQANKLGV |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Yamasaki A., Tani K., Yamamoto A., Kitamura N., Komada M. (2006). The Ca2+-binding protein ALG-2 is recruited to endoplasmic reticulum exit sites by Sec31A and stabilizes the localization of Sec31A. Mol. Biol. Cell. 17: 4876—4887. PMID 16957052 DOI:10.1091/mbc.E06-05-0444
- Shibata H., Suzuki H., Yoshida H., Maki M. (2007). ALG-2 directly binds Sec31A and localizes at endoplasmic reticulum exit sites in a Ca2+-dependent manner. Biochem. Biophys. Res. Commun. 353: 756—763. PMID 17196169 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.12.101
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17052 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O94979 (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |