SDPR : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

SDPR

Ідентифікатори

Символи

CAVIN2, PS-p68, SDR, cavin-2, SDPR, serum deprivation response, caveolae associated protein 2

Зовнішні ІД

OMIM: 606728 MGI: 99513 HomoloGene: 3422 GeneCards: CAVIN2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphatidylserine binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phospholipid binding • protein kinase C binding • lipid binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • membrane raft • гіалоплазма • мембрана • caveola • нуклеоплазма • клітинна мембрана • actin cytoskeleton
Біологічний процес	• plasma membrane tubulation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8436


20324

Ensembl


ENSG00000168497


ENSMUSG00000045954

UniProt


O95810


Q63918

RefSeq (мРНК)


NM_004657


NM_138741

RefSeq (білок)


NP_004648


NP_620080

Локус (UCSC)

Хр. 2: 191.83 – 191.85 Mb

Хр. 1: 51.33 – 51.34 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SDPR (англ. Serum deprivation response) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 425 амінокислот, а молекулярна маса — 47 173^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGEDAAQAEK	FQHPGSDMRQ	EKPSSPSPMP	SSTPSPSLNL	GNTEEAIRDN
SQVNAVTVLT	LLDKLVNMLD	AVQENQHKME	QRQISLEGSV	KGIQNDLTKL
SKYQASTSNT	VSKLLEKSRK	VSAHTRAVKE	RMDRQCAQVK	RLENNHAQLL
RRNHFKVLIF	QEENEIPASV	FVKQPVSGAV	EGKEELPDEN	KSLEETLHTV
DLSSDDDLPH	DEEALEDSAE	EKVEESRAEK	IKRSSLKKVD	SLKKAFSRQN
IEKKMNKLGT	KIVSVERREK	IKKSLTSNHQ	KISSGKSSPF	KVSPLTFGRK
KVREGESHAE	NETKSEDLPS	SEQMPNDQEE	ESFAEGHSEA	SLASALVEGE
IAEEAAEKAT	SRGSNSGMDS	NIDLTIVEDE	EEESVALEQA	QKVRYEGSYA
LTSEEAERSD	GDPVQPAVLQ	VHQTS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Burgener R., Wolf M., Ganz T., Baggiolini M. (1990). Purification and characterization of a major phosphatidylserine-binding phosphoprotein from human platelets. Biochem. J. 269: 729—734. PMID 2390065 DOI:10.1042/bj2690729
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10690 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
↑ UniProt, O95810 (англ.) . Архів оригіналу за 20 лютого 2017. Процитовано 6 лютого 2017.