SDF4

Ідентифікатори

Символи

SDF4, Cab45, SDF-4, stromal cell derived factor 4

Зовнішні ІД

OMIM: 614282 MGI: 108079 HomoloGene: 32121 GeneCards: SDF4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • identical protein binding • calcium ion binding
Клітинна компонента	• cell projection • екзосома • bleb • late endosome • Golgi lumen • цитоплазма • мембрана • клітинна мембрана • комплекс Ґольджі • ендоплазматичний ретикулум
Біологічний процес	• УФ-захист • zymogen granule exocytosis • response to ethanol • cerebellum development • calcium-ion regulated exocytosis • екзоцитоз • fat cell differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51150


20318

Ensembl


ENSG00000078808


ENSMUSG00000029076

UniProt


Q9BRK5


Q61112

RefSeq (мРНК)


NM_016176 NM_016547


NM_011341 NM_001302467 NM_001302468 NM_001302469

RefSeq (білок)


NP_057260 NP_057631


NP_001289396 NP_001289397 NP_001289398 NP_035471

Локус (UCSC)

Хр. 1: 1.22 – 1.23 Mb

Хр. 4: 156.08 – 156.1 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SDF4 (англ. Stromal cell derived factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 362 амінокислот, а молекулярна маса — 41 807^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVWPWVAMAS	RWGPLIGLAP	CCLWLLGAVL	LMDASARPAN	HSSTRERVAN
REENEILPPD	HLNGVKLEMD	GHLNRGFHQE	VFLGKDLGGF	DEDAEPRRSR
RKLMVIFSKV	DVNTDRKISA	KEMQRWIMEK	TAEHFQEAME	ESKTHFRAVD
PDGDGHVSWD	EYKVKFLASK	GHSEKEVADA	IRLNEELKVD	EETQEVLENL
KDRWYQADSP	PADLLLTEEE	FLSFLHPEHS	RGMLRFMVKE	IVRDLDQDGD
KQLSVPEFIS	LPVGTVENQQ	GQDIDDNWVK	DRKKEFEELI	DSNHDGIVTA
EELESYMDPM	NEYNALNEAK	QMIAVADENQ	NHHLEPEEVL	KYSEFFTGSK
LVDYARSVHE	EF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як екзоцитоз, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках, апараті гольджі.

Література

Koivu T., Laitinen S., Riento K., Olkkonen V.M. (1997). Sequence of a human cDNA encoding Cab45, a Ca2+-binding protein with six EF-hand motifs. DNA Seq. 7: 217—220. PMID 9254016 DOI:10.3109/10425179709034038
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24188 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9BRK5 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.