SDC2

Ідентифікатори

Символи

SDC2, CD362, HSPG, HSPG1, SYND2, syndecan 2

Зовнішні ІД

OMIM: 142460 MGI: 1349165 HomoloGene: 2253 GeneCards: SDC2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• PDZ domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • lysosomal lumen • Golgi lumen • endoplasmic reticulum lumen • cell surface • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix
Біологічний процес	• glycosaminoglycan metabolic process • диференціація клітин • ephrin receptor signaling pathway • нейробіологія розвитку • retinoid metabolic process • regulation of dendrite morphogenesis • біолюмінесценція • glycosaminoglycan catabolic process • glycosaminoglycan biosynthetic process • leukocyte migration • посттрансляційна модифікація • cell migration • dendrite morphogenesis • GO:0022610 життєдіяльність
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6383


15529

Ensembl


ENSG00000169439


ENSMUSG00000022261

UniProt


P34741


P43407

RefSeq (мРНК)


NM_002998


NM_008304

RefSeq (білок)


NP_002989


NP_032330

Локус (UCSC)

Хр. 8: 96.49 – 96.61 Mb

Хр. 15: 32.92 – 33.04 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SDC2 (англ. Syndecan 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 201 амінокислот, а молекулярна маса — 22 160^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRRAWILLTL	GLVACVSAES	RAELTSDKDM	YLDNSSIEEA	SGVYPIDDDD
YASASGSGAD	EDVESPELTT	SRPLPKILLT	SAAPKVETTT	LNIQNKIPAQ
TKSPEETDKE	KVHLSDSERK	MDPAEEDTNV	YTEKHSDSLF	KRTEVLAAVI
AGGVIGFLFA	IFLILLLVYR	MRKKDEGSYD	LGERKPSSAA	YQKAPTKEFY
A

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до світлочутливих білків, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як люмінесценція, диференціація клітин, нейрогенез. Локалізований у мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Halim A., Nilsson J., Ruetschi U., Hesse C., Larson G. (2011). Human urinary glycoproteomics; attachment site specific analysis of N-and O-linked glycosylations by CID and ECD. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 22171320 DOI:10.1074/mcp.M111.013649
Marynen P., Zhang J., Cassiman J.-J., den Berghe H., David G. (1989). Partial primary structure of the 48- and 90-kilodalton core proteins of cell surface-associated heparan sulfate proteoglycans of lung fibroblasts. Prediction of an integral membrane domain and evidence for multiple distinct core proteins at the cell surface of human lung fibroblasts. J. Biol. Chem. 264: 7017—7024. PMID 2523388

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10659 (англ.) . Архів оригіналу за 4 грудня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, P34741 (англ.) . Архів оригіналу за 28 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.