SCP2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1QND, 2C0L

Ідентифікатори

Символи

SCP2, NLTP, NSL-TP, SCP-2, SCP-CHI, SCP-X, SCPX, sterol carrier protein 2, SCOX

Зовнішні ІД

OMIM: 184755 MGI: 98254 HomoloGene: 37717 GeneCards: SCP2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • phosphatidylinositol transfer activity • fatty-acyl-CoA binding • acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups • sterol transporter activity • oleic acid binding • long-chain fatty acyl-CoA binding • cholesterol binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • propanoyl-CoA C-acyltransferase activity • каталітична активність • signaling receptor binding • acyltransferase activity • lipid binding • propionyl-CoA C2-trimethyltridecanoyltransferase activity
Клітинна компонента	• мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • пероксисома • нуклеоплазма • peroxisomal matrix • мітохондрія • екзосома • цитоплазма • гіалоплазма • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• progesterone biosynthetic process • peroxisome organization • lipid transport • inositol trisphosphate biosynthetic process • alpha-linolenic acid metabolic process • positive regulation of steroid metabolic process • lipid hydroperoxide transport • positive regulation of intracellular cholesterol transport • fatty acid beta-oxidation using acyl-CoA oxidase • обмін речовин • protein localization to plasma membrane • bile acid biosynthetic process • sterol transport • steroid biosynthetic process • phospholipid transport • GO:0015915 транспорт • protein targeting to peroxisome
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6342


20280

Ensembl


ENSG00000116171


ENSMUSG00000028603

UniProt


P22307


P32020

RefSeq (мРНК)

NM_001007098 NM_001007099 NM_001007100 NM_001007250 NM_001193599
NM_001193600 NM_001193617 NM_002979 NM_001330587


NM_011327

RefSeq (білок)

NP_001007099 NP_001007100 NP_001007101 NP_001007251 NP_001180528
NP_001180529 NP_001180546 NP_001317516 NP_002970


NP_035457

Локус (UCSC)

Хр. 1: 52.93 – 53.05 Mb

Хр. 4: 107.9 – 108 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SCP2 (англ. Sterol carrier protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 547 амінокислот, а молекулярна маса — 58 994^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSSPWEPAT	LRRVFVVGVG	MTKFVKPGAE	NSRDYPDLAE	EAGKKALADA
QIPYSAVDQA	CVGYVFGDST	CGQRAIYHSL	GMTGIPIINV	NNNCATGSTA
LFMARQLIQG	GVAECVLALG	FEKMSKGSLG	IKFSDRTIPT	DKHVDLLINK
YGLSAHPVAP	QMFGYAGKEH	MEKYGTKIEH	FAKIGWKNHK	HSVNNPYSQF
QDEYSLDEVM	ASKEVFDFLT	ILQCCPTSDG	AAAAILASEA	FVQKYGLQSK
AVEILAQEMM	TDLPSSFEEK	SIIKMVGFDM	SKEAARKCYE	KSGLTPNDID
VIELHDCFST	NELLTYEALG	LCPEGQGATL	VDRGDNTYGG	KWVINPSGGL
ISKGHPLGAT	GLAQCAELCW	QLRGEAGKRQ	VPGAKVALQH	NLGIGGAVVV
TLYKMGFPEA	ASSFRTHQIE	AVPTSSASDG	FKANLVFKEI	EKKLEEEGEQ
FVKKIGGIFA	FKVKDGPGGK	EATWVVDVKN	GKGSVLPNSD	KKADCTITMA
DSDFLALMTG	KMNPQSAFFQ	GKLKITGNMG	LAMKLQNLQL	QPGNAKL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, ацилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт ліпідів, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії, пероксисомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Yamamoto R. (1992). Localization of human sterol carrier protein 2 gene and cDNA expression in COS-7 cell. Hokkaido Igaku Zasshi. 67: 839—848. PMID 1483685

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10606 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P22307 (англ.) . Архів оригіналу за 18 грудня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.