S100A12

S100A12
Наявні структури
PDBПошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1E8A, 1GQM, 1ODB, 2M9G, 2WC8, 2WCB, 2WCE, 2WCF

Ідентифікатори
Символи S100A12, CAAF1, CAGC, CGRP, ENRAGE, MRP-6, MRP6, p6, S100 calcium binding protein A12, EN-RAGE
Зовнішні ІД OMIM: 603112 HomoloGene: 48361 GeneCards: S100A12
Онтологія гена
Молекулярна функція

• calcium ion binding
• zinc ion binding
• зв'язування з іоном металу
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• RAGE receptor binding
• copper ion binding

Клітинна компонента

• цитоплазма
• гіалоплазма
• мембрана
• клітинна мембрана
• extracellular region
• цитоскелет
• клітинне ядро
• secretory granule lumen

Біологічний процес

• mast cell activation
• positive regulation of inflammatory response
• positive regulation of MAP kinase activity
• monocyte chemotaxis
• процес імунної системи
• defense response to fungus
• neutrophil chemotaxis
• defense response to bacterium
• positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
• positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
• xenobiotic metabolic process
• вроджений імунітет
• inflammatory response
• neutrophil degranulation
• antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide
• killing of cells of other organism

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6283
н/д
Ensembl
ENSG00000163221
н/д
UniProt
P80511
н/д
RefSeq (мРНК)
NM_005621
н/д
RefSeq (білок)
NP_005612
н/д
Локус (UCSC) Хр. 1: 153.37 – 153.38 Mb н/д
PubMed search [1] н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

S100A12 (англ. S100 calcium binding protein A12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 92 амінокислот, а молекулярна маса — 10 575[3].

Послідовність амінокислот

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків, фунгіцидів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь. Білок має сайт для зв'язування з іоном міді, іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані. Також секретований назовні.

Література

  • Wicki R., Marenholz I., Mischke D., Schaefer B.W., Heizmann C.W. (1996). Characterization of the human S100A12 (calgranulin C, p6, CAAF1, CGRP) gene, a new member of the S100 gene cluster on chromosome 1q21. Cell Calcium. 20: 459—464. PMID 8985590 DOI:10.1016/S0143-4160(96)90087-1
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Marti T., Erttmann K.D., Gallin M.Y. (1996). Host-parasite interaction in human onchocerciasis: identification and sequence analysis of a novel human calgranulin. Biochem. Biophys. Res. Commun. 221: 454—458. PMID 8619876 DOI:10.1006/bbrc.1996.0616
  • Guignard F., Mauel J., Markert M. (1995). Identification and characterization of a novel human neutrophil protein related to the S100 family. Biochem. J. 309: 395—401. PMID 7626002 DOI:10.1042/bj3090395
  • Filipek A., Jastrzebska B., Nowotny M., Kuznicki J. (2002). CacyBP/SIP, a calcyclin and Siah-1-interacting protein, binds EF-hand proteins of the S100 family. J. Biol. Chem. 277: 28848—28852. PMID 12042313 DOI:10.1074/jbc.M203602200
  • Moroz O.V., Dodson G.G., Wilson K.S., Lukanidin E., Bronstein I.B. (2003). Multiple structural states of S100A12: A key to its functional diversity. Microsc. Res. Tech. 60: 581—592. PMID 12645006 DOI:10.1002/jemt.10300

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10489 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
  3. ↑ UniProt, P80511 (англ.) . Архів оригіналу за 8 травня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»