RYBP

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3IXS

Ідентифікатори

Символи

RYBP, AAP1, DEDAF, YEAF1, APAP-1, RING1 and YY1 binding protein

Зовнішні ІД

OMIM: 607535 MGI: 3648043 HomoloGene: 8159 GeneCards: RYBP

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • зв'язування з іоном металу
Клітинна компонента	• цитоплазма • PcG protein complex • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• multicellular organism development • histone H2A monoubiquitination • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0097285 апоптоз • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • positive regulation of apoptotic process • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of G0 to G1 transition
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23429


628746

Ensembl


ENSG00000281766 ENSG00000163602


н/д

UniProt


Q8N488


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_012234


XM_036158262

RefSeq (білок)


NP_036366


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 3: 72.37 – 72.45 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RYBP (англ. RING1 and YY1 binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 228 амінокислот, а молекулярна маса — 24 822^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTMGDKKSPT	RPKRQAKPAA	DEGFWDCSVC	TFRNSAEAFK	CSICDVRKGT
STRKPRINSQ	LVAQQVAQQY	ATPPPPKKEK	KEKVEKQDKE	KPEKDKEISP
SVTKKNTNKK	TKPKSDILKD	PPSEANSIQS	ANATTKTSET	NHTSRPRLKN
VDRSTAQQLA	VTVGNVTVII	TDFKEKTRSS	STSSSTVTSS	AGSEQQNQSS
SGSESTDKGS	SRSSTPKGDM	SAVNDESF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Zheng L., Schickling O., Peter M.E., Lenardo M.J. (2001). The death effector domain-associated factor plays distinct regulatory roles in the nucleus and cytoplasm. J. Biol. Chem. 276: 31945—31952. PMID 11395500 DOI:10.1074/jbc.M102799200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Gearhart M.D., Corcoran C.M., Wamstad J.A., Bardwell V.J. (2006). Polycomb group and SCF ubiquitin ligases are found in a novel BCOR complex that is recruited to BCL6 targets. Mol. Cell. Biol. 26: 6880—6889. PMID 16943429 DOI:10.1128/MCB.00630-06

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10480 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q8N488 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.