RTKN

Ідентифікатори

Символи

RTKN, rhotekin

Зовнішні ІД

OMIM: 602288 MGI: 107371 HomoloGene: 7522 GeneCards: RTKN

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • GTP binding • GTPase inhibitor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• гіалоплазма • компонент клітини • actomyosin contractile ring
Біологічний процес	• GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0097285 апоптоз • GO:0034259 negative regulation of GTPase activity • regulation of apoptotic process • Rho protein signal transduction • septin cytoskeleton organization • mitotic cytokinesis • actomyosin contractile ring assembly • cortical cytoskeleton organization • septin ring organization • protein localization to mitotic actomyosin contractile ring
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6242


20166

Ensembl


ENSG00000114993


ENSMUSG00000034930

UniProt


Q9BST9


Q8C6B2

RefSeq (мРНК)


NM_001015055 NM_001015056 NM_033046


NM_001136227 NM_009106 NM_133641 NM_001355524 NM_001355525

RefSeq (білок)


NP_001015055 NP_001015056 NP_149035


NP_001129699 NP_033132 NP_598396 NP_001342453 NP_001342454

Локус (UCSC)

Хр. 2: 74.43 – 74.44 Mb

Хр. 6: 83.11 – 83.13 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RTKN (англ. Rhotekin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 563 амінокислот, а молекулярна маса — 62 667^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFSRNHRSRV	TVARGSALEM	EFKRGRFRLS	LFSDLPEDTE	LQRKLDHEIR
MREGACKLLA	ACSQREQALE	ATKSLLVCNS	RILSYMGELQ	RRKEAQVLGK
TSRRPSDSGP	PAERSPCRGR	VCISDLRIPL	MWKDTEYFKN	KGDLHRWAVF
LLLQLGEHIQ	DTEMILVDRT	LTDISFQSNV	LFAEAGPDFE	LRLELYGACV
EEEGALTGGP	KRLATKLSSS	LGRSSGRRVR	ASLDSAGGSG	SSPILLPTPV
VGGPRYHLLA	HTTLTLAAVQ	DGFRTHDLTL	ASHEENPAWL	PLYGSVCCRL
AAQPLCMTQP	TASGTLRVQQ	AGEMQNWAQV	HGVLKGTNLF	CYRQPEDADT
GEEPLLTIAV	NKETRVRAGE	LDQALGRPFT	LSISNQYGDD	EVTHTLQTES
REALQSWMEA	LWQLFFDMSQ	WKQCCDEIMK	IETPAPRKPP	QALAKQGSLY
HEMAIEPLDD	IAAVTDILTQ	REGARLETPP	PWLAMFTDQP	ALPNPCSPAS
VAPAPDWTHP	LPWGRPRTFS	LDAVPPDHSP	RARSVAPLPP	QRSPRTRGLC
SKGQPRTWLQ	SPV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ.

Література

Reynaud C., Fabre S., Jalinot P. (2000). The PDZ protein TIP-1 interacts with the Rho effector rhotekin and is involved in Rho signaling to the serum response element. J. Biol. Chem. 275: 33962—33968. PMID 10940294 DOI:10.1074/jbc.M000465200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Liu C.-A., Wang M.-J., Chi C.-W., Wu C.-W., Chen J.-Y. (2004). Rho/Rhotekin-mediated NF-kappaB activation confers resistance to apoptosis. Oncogene. 23: 8731—8742. PMID 15480428 DOI:10.1038/sj.onc.1208106

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10466 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9BST9 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.