RTFDC1

RTF1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2BZE, 2DB9, 3U1U, 4L1P, 4L1U

Ідентифікатори

Символи

15890 RTF1, RTF2, GTL7, KIAA0252, RTF1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component, RTF2, C20orf43, CDAO5, HSPC164, SHUJUN-3, replication termination factor 2 domain containing 1, replication termination factor 2, RTFDC1

Зовнішні ІД

OMIM: 611633 MGI: 1309480 HomoloGene: 133868 9501 GeneCards: RTF2 RTF1, RTF2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded DNA binding • DNA binding • RNA polymerase II C-terminal domain phosphoserine binding • RNA binding • молекулярна функція
Клітинна компонента	• ядерце • клітинне ядро • Cdc73/Paf1 complex • нуклеоплазма • компонент клітини • replication fork • хромосома
Біологічний процес	• blastocyst growth • GO:0071110, GO:0036413, GO:0036414 histone modification • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter • histone H3-K4 trimethylation • positive regulation of histone H3-K4 methylation • transcription, DNA-templated • Wnt signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • stem cell population maintenance • endodermal cell fate commitment • transcription by RNA polymerase II • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • Убіквітин-залежний протеоліз • mitotic DNA replication termination • site-specific DNA replication termination at RTS1 barrier • GO:0022610 життєдіяльність • cellular response to hydroxyurea • regulation of DNA stability
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

51507/ Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23168,51507 23168,51507


76246

Ensembl


ENSG00000137815 ENSG00000022277


ENSMUSG00000027304

UniProt


Q92541 Q9BY42


A2AQ19

RefSeq (мРНК)


NM_015138 NM_001283035 NM_001283036 NM_001283037 NM_016407


NM_030112

RefSeq (білок)


NP_055953 NP_001269964 NP_001269965 NP_001269966 NP_057491


NP_084388

Локус (UCSC)

Хр. 15: 41.41 – 41.48 Mb

Хр. 2: 119.68 – 119.74 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RTFDC1 (англ. Replication termination factor 2 domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 306 амінокислот, а молекулярна маса — 33 887^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGCDGGTIPK	RHELVKGPKK	VEKVDKDAEL	VAQWNYCTLS	QEILRRPIVA
CELGRLYNKD	AVIEFLLDKS	AEKALGKAAS	HIKSIKNVTE	LKLSDNPAWE
GDKGNTKGDK	HDDLQRARFI	CPVVGLEMNG	RHRFCFLRCC	GCVFSERALK
EIKAEVCHTC	GAAFQEDDVI	MLNGTKEDVD	VLKTRMEERR	LRAKLEKKTK
KPKAAESVSK	PDVSEEAPGP	SKVKTGKPEE	ASLDSREKKT	NLAPKSTAMN
ESSSGKAGKP	PCGATKRSIA	DSEESEAYKS	LFTTHSSAKR	SKEESAHWVT
HTSYCF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15890 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9BY42 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.