RNGTT

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2C46, 3S24

Ідентифікатори

Символи

RNGTT, CAP1A, HCE, HCE1, hCAP, RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase

Зовнішні ІД

OMIM: 603512 MGI: 1329041 HomoloGene: 37851 GeneCards: RNGTT

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein tyrosine/serine/threonine phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • protein tyrosine phosphatase activity • polynucleotide 5'-phosphatase activity • RNA guanylyltransferase activity • triphosphatase activity • nucleotidyltransferase activity • mRNA guanylyltransferase activity • каталітична активність • hydrolase activity • nucleotide binding • GTP binding • transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• mRNA processing • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • GO:0016576 protein dephosphorylation • transcription by RNA polymerase II • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • 7-methylguanosine mRNA capping • обмін речовин • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • polynucleotide 5' dephosphorylation • GO:0022415 viral process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8732


24018

Ensembl


ENSG00000111880


ENSMUSG00000028274

UniProt


O60942


O55236

RefSeq (мРНК)


NM_001286426 NM_001286428 NM_003800


NM_011884 NM_001305273

RefSeq (білок)


NP_001273355 NP_001273357 NP_003791


NP_001292202 NP_036014

Локус (UCSC)

Хр. 6: 88.61 – 88.96 Mb

Хр. 4: 33.31 – 33.5 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RNGTT (англ. RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 597 амінокислот, а молекулярна маса — 68 557^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAHNKIPPRW	LNCPRRGQPV	AGRFLPLKTM	LGPRYDSQVA	EENRFHPSML
SNYLKSLKVK	MGLLVDLTNT	SRFYDRNDIE	KEGIKYIKLQ	CKGHGECPTT
ENTETFIRLC	ERFNERNPPE	LIGVHCTHGF	NRTGFLICAF	LVEKMDWSIE
AAVATFAQAR	PPGIYKGDYL	KELFRRYGDI	EEAPPPPLLP	DWCFEDDEDE
DEDEDGKKES	EPGSSASFGK	RRKERLKLGA	IFLEGVTVKG	VTQVTTQPKL
GEVQQKCHQF	CGWEGSGFPG	AQPVSMDKQN	IKLLDLKPYK	VSWKADGTRY
MMLIDGTNEV	FMIDRDNSVF	HVSNLEFPFR	KDLRMHLSNT	LLDGEMIIDR
VNGQAVPRYL	IYDIIKFNSQ	PVGDCDFNVR	LQCIEREIIS	PRHEKMKTGL
IDKTQEPFSV	RNKPFFDICT	SRKLLEGNFA	KEVSHEMDGL	IFQPTGKYKP
GRCDDILKWK	PPSLNSVDFR	LKITRMGGEG	LLPQNVGLLY	VGGYERPFAQ
IKVTKELKQY	DNKIIECKFE	NNSWVFMRQR	TDKSFPNAYN	TAMAVCNSIS
NPVTKEMLFE	FIDRCTAASQ	GQKRKHHLDP	DTELMPPPPP	KRPRPLT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у ядрі.

Література

Yamada-Okabe T., Doi R., Shimmi O., Arisawa M., Yamada-Okabe H. (1998). Isolation and characterization of a human cDNA for mRNA 5'-capping enzyme. Nucleic Acids Res. 26: 1700—1706. PMID 9512541 DOI:10.1093/nar/26.7.1700
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Pillutla R.C., Yue Z., Maldonado E., Shatkin A.J. (1998). Recombinant human mRNA cap methyltransferase binds capping enzyme/RNA polymerase IIo complexes. J. Biol. Chem. 273: 21443—21446. PMID 9705270 DOI:10.1074/jbc.273.34.21443
Wen Y., Shatkin A.J. (1999). Transcription elongation factor hSPT5 stimulates mRNA capping. Genes Dev. 13: 1774—1779. PMID 10421630 DOI:10.1101/gad.13.14.1774
Chiu Y.-L., Coronel E., Ho C.K., Shuman S., Rana T.M. (2001). HIV-1 Tat protein interacts with mammalian capping enzyme and stimulates capping of TAR RNA. J. Biol. Chem. 276: 12959—12966. PMID 11278368 DOI:10.1074/jbc.M007901200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10073 (англ.) . Архів оригіналу за 1 квітня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, O60942 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.