RNF146

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2D8T, 3V3L

Ідентифікатори

Символи

RNF146, dJ351K20.1, ring finger protein 146

Зовнішні ІД

OMIM: 612137 MGI: 1915281 HomoloGene: 12227 GeneCards: RNF146

Онтологія гена
Молекулярна функція	• zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • poly-ADP-D-ribose binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • transferase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • клітинна мембрана
Біологічний процес	• positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein K48-linked ubiquitination • Убіквітин-залежний протеоліз • protein autoubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process • Wnt signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


81847


68031

Ensembl


ENSG00000118518


ENSMUSG00000038876

UniProt


Q9NTX7


Q9CZW6

RefSeq (мРНК)

NM_001242844 NM_001242845 NM_001242846 NM_001242847 NM_001242848
NM_001242849 NM_001242850 NM_001242851 NM_001242852 NM_030963


NM_001110196 NM_001110197 NM_001110198 NM_001284279 NM_026518

RefSeq (білок)

NP_001229773 NP_001229774 NP_001229775 NP_001229776 NP_001229777
NP_001229778 NP_001229779 NP_001229780 NP_001229781 NP_112225


NP_001103666 NP_001103667 NP_001103668 NP_001271208 NP_080794

Локус (UCSC)

Хр. 6: 127.27 – 127.29 Mb

Хр. 10: 29.22 – 29.24 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RNF146 (англ. Ring finger protein 146) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 359 амінокислот, а молекулярна маса — 38 950^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMAGCGEIDH	SINMLPTNRK	ANESCSNTAP	SLTVPECAIC	LQTCVHPVSL
PCKHVFCYLC	VKGASWLGKR	CALCRQEIPE	DFLDKPTLLS	PEELKAASRG
NGEYAWYYEG	RNGWWQYDER	TSRELEDAFS	KGKKNTEMLI	AGFLYVADLE
NMVQYRRNEH	GRRRKIKRDI	IDIPKKGVAG	LRLDCDANTV	NLARESSADG
ADSVSAQSGA	SVQPLVSSVR	PLTSVDGQLT	SPATPSPDAS	TSLEDSFAHL
QLSGDNTAER	SHRGEGEEDH	ESPSSGRVPA	PDTSIEETES	DASSDSEDVS
AVVAQHSLTQ	QRLLVSNANQ	TVPDRSDRSG	TDRSVAGGGT	VSVSVRSRRP
DGQCTVTEV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

von Rotz R.C., Kins S., Hipfel R., von der Kammer H., Nitsch R.M. (2005). The novel cytosolic RING finger protein dactylidin is up-regulated in brains of patients with Alzheimer's disease. Eur. J. Neurosci. 21: 1289—1298. PMID 15813938 DOI:10.1111/j.1460-9568.2005.03977.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Menachem T.D., Laitman Y., Kaufman B., Friedman E. (2009). The RNF146 and ECHDC1 genes as candidates for inherited breast and ovarian cancer in Jewish Ashkenazi women. Fam. Cancer. 8: 399—402. PMID 19517271 DOI:10.1007/s10689-009-9255-7

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21336 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NTX7 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.