RNF139 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | RNF139, HRCA1, RCA1, TRC8, ring finger protein 139 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603046 MGI: 1923091 HomoloGene: 5222 GeneCards: RNF139 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
nonpapillary renal cell carcinoma[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • ubiquitin-like protein transferase activity • protease binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transferase activity • ligase activity • signaling receptor activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • Derlin-1 retrotranslocation complex • endoplasmic reticulum membrane • endoplasmic reticulum quality control compartment • система ендомембран |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of translation • ERAD pathway • regulation of ER to Golgi vesicle-mediated transport • regulation of protein ubiquitination • protein polyubiquitination • regulation of protein processing • positive regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein destabilization • Убіквітин-залежний протеоліз • negative regulation of cell population proliferation • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • endoplasmic reticulum mannose trimming • GO:0072468 сигнальна трансдукція |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 124.47 – 124.49 Mb | Хр. 15: 58.76 – 58.78 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RNF139 (англ. Ring finger protein 139) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 664 амінокислот, а молекулярна маса — 75 994[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAAVGPPQQQ | | VRMAHQQVWA | | ALEVALRVPC | | LYIIDAIFNS | | YPDSSQSRFC |
IVLQIFLRLF | | GVFASSIVLI | | LSQRSLFKFY | | TYSSAFLLAA | | TSVLVNYYAS |
LHIDFYGAYN | | TSAFGIELLP | | RKGPSLWMAL | | IVLQLTFGIG | | YVTLLQIHSI |
YSQLIILDLL | | VPVIGLITEL | | PLHIRETLLF | | TSSLILTLNT | | VFVLAVKLKW |
FYYSTRYVYL | | LVRHMYRIYG | | LQLLMEDTWK | | RIRFPDILRV | | FWLTRVTAQA |
TVLMYILRMA | | NETDSFFISW | | DDFWDLICNL | | IISGCDSTLT | | VLGMSAVISS |
VAHYLGLGIL | | AFIGSTEEDD | | RRLGFVAPVL | | FFILALQTGL | | SGLRPEERLI |
RLSRNMCLLL | | TAVLHFIHGM | | TDPVLMSLSA | | SHVSSFRRHF | | PVLFVSACLF |
ILPVLLSYVL | | WHHYALNTWL | | FAVTAFCVEL | | CLKVIVSLTV | | YTLFMIDGYY |
NVLWEKLDDY | | VYYVRSTGSI | | IEFIFGVVMF | | GNGAYTMMFE | | SGSKIRAFMM |
CLHAYFNIYL | | QAKNGWKTFM | | NRRTAVKKIN | | SLPEIKGSRL | | QEINDVCAIC |
YHEFTTSARI | | TPCNHYFHAL | | CLRKWLYIQD | | TCPMCHQKVY | | IEDDIKDNSN |
VSNNNGFIPP | | NETPEEAVRE | | AAAESDRELN | | EDDSTDCDDD | | VQRERNGVIQ |
HTGAAAEEFN | | DDTD |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Irisawa M., Inoue J., Ozawa N., Mori K., Sato R. (2009). The sterol-sensing endoplasmic reticulum (ER) membrane protein TRC8 hampers ER to Golgi transport of sterol regulatory element-binding protein-2 (SREBP-2)/SREBP cleavage-activated protein and reduces SREBP-2 cleavage. J. Biol. Chem. 284: 28995—29004. PMID 19706601 DOI:10.1074/jbc.M109.041376
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з RNF139 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17023 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8WU17 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |