RIPOR2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | RIPOR2, C6orf32, DIFF40, DIFF48, MYONAP, PL48, FAM65B, DFNB104, family with sequence similarity 65 member B, RHO family interacting cell polarization regulator 2, DFNA21 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 611410 MGI: 2444879 HomoloGene: 9284 GeneCards: RIPOR2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
alcohol abuse, autosomal recessive nonsyndromic deafness 104[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • 14-3-3 protein binding • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • клітинна мембрана • cell projection • мембрана • цитоплазма • apical plasma membrane • цитоскелет • Філоподія • stereocilium • stereocilium membrane |
---|
Біологічний процес | • multicellular organism development • диференціація клітин • muscle organ development • слух • skeletal muscle fiber development • positive regulation of myoblast differentiation • positive regulation of myoblast fusion • negative regulation of establishment of T cell polarity • negative regulation of T cell migration • negative regulation of T cell proliferation • regulation of mitotic spindle assembly • хемотаксис • адгезія клітин • negative regulation of signal transduction • negative regulation of cell adhesion • negative regulation of Rho protein signal transduction • positive regulation of filopodium assembly • positive regulation of neutrophil chemotaxis • negative regulation of protein localization to cell leading edge • cellular response to chemokine • regulation of establishment of cell polarity • positive regulation of neutrophil extravasation • negative regulation of Rho guanyl-nucleotide exchange factor activity • establishment of protein localization • protein homooligomerization • auditory receptor cell stereocilium organization • cellular response to mechanical stimulus |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001286445 NM_001286446 NM_001286447 NM_014722 NM_015864
| NM_001346031 NM_001346032 |
| | NM_001080381 NM_001286100 NM_001286101 NM_029679 NM_178658 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001273374 NP_001273375 NP_001273376 NP_001332960 NP_001332961
| NP_055537 NP_056948 |
| NP_001073850 NP_001273029 NP_001273030 NP_083955 NP_848773
| NP_001389841 NP_001389842 NP_001389843 NP_001389844 NP_001389845 NP_001389846 NP_001389847 NP_001389848 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 24.8 – 25.04 Mb | Хр. 13: 24.69 – 24.92 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RIPOR2 (англ. RHO family interacting cell polarization regulator 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 068 амінокислот, а молекулярна маса — 118 519[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLVGSQSFSP | | GGPNGIIRSQ | | SFAGFSGLQE | | RRSRCNSFIE | | NSSALKKPQA |
KLKKMHNLGH | | KNNNPPKEPQ | | PKRVEEVYRA | | LKNGLDEYLE | | VHQTELDKLT |
AQLKDMKRNS | | RLGVLYDLDK | | QIKTIERYMR | | RLEFHISKVD | | ELYEAYCIQR |
RLQDGASKMK | | QAFATSPASK | | AARESLTEIN | | RSFKEYTENM | | CTIEVELENL |
LGEFSIKMKG | | LAGFARLCPG | | DQYEIFMKYG | | RQRWKLKGKI | | EVNGKQSWDG |
EETVFLPLIV | | GFISIKVTEL | | KGLATHILVG | | SVTCETKELF | | AARPQVVAVD |
INDLGTIKLN | | LEITWYPFDV | | EDMTASSGAG | | NKAAALQRRM | | SMYSQGTPET |
PTFKDHSFFR | | WLHPSPDKPR | | RLSVLSALQD | | TFFAKLHRSR | | SFSDLPSLRP |
SPKAVLELYS | | NLPDDIFENG | | KAAEEKMPLS | | LSFSDLPNGD | | CALTSHSTGS |
PSNSTNPEIT | | ITPAEFNLSS | | LASQNEGMDD | | TSSASSRNSL | | GEGQEPKSHL |
KEEDPEEPRK | | PASAPSEACR | | RQSSGAGAEH | | LFLENDVAEA | | LLQESEEASE |
LKPVELDTSE | | GNITKQLVKR | | LTSAEVPMAT | | DRLLSEGSVG | | GESEGCRSFL |
DGSLEDAFNG | | LLLALEPHKE | | QYKEFQDLNQ | | EVMNLDDILK | | CKPAVSRSRS |
SSLSLTVESA | | LESFDFLNTS | | DFDEEEDGDE | | VCNVGGGADS | | VFSDTETEKH |
SYRSVHPEAR | | GHLSEALTED | | TGVGTSVAGS | | PLPLTTGNES | | LDITIVRHLQ |
YCTQLVQQIV | | FSSKTPFVAR | | SLLEKLSRQI | | QVMEKLAAVS | | DENIGNISSV |
VEAIPEFHKK | | LSLLSFWTKC | | CSPVGVYHSP | | ADRVMKQLEA | | SFARTVNKEY |
PGLADPVFRT | | LVSQILDRAE | | PLLSSSLSSE | | VVTVFQYYSY | | FTSHGVSDLE |
SYLSQLARQV | | SMVQTLQSLR | | DEKLLQTMSD | | LAPSNLLAQQ | | EVLRTLALLL |
TREDNEVSEA | | VTLYLAAASK | | NQHFREKALL | | YYCEALTKTN | | LQLQKAACLA |
LKILEATESI | | KMLVTLCQSD | | TEEIRNVASE | | TLLSLGEDGR | | LAYEQLDKFP |
RDCVKVGGRH | | GTEVATAF |
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів, інгібіторів передачі внутрішньоклітинних сигналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, хемотаксис, диференціація клітин, міогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках.
Література
- Dakour J., Li H., Morrish D.W. (1997). PL48: a novel gene associated with cytotrophoblast and lineage-specific HL-60 cell differentiation. Gene. 185: 153—157. PMID 9055809 DOI:10.1016/S0378-1119(96)00587-2
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Yoon S., Molloy M.J., Wu M.P., Cowan D.B., Gussoni E. (2007). C6ORF32 is upregulated during muscle cell differentiation and induces the formation of cellular filopodia. Dev. Biol. 301: 70—81. PMID 17150207 DOI:10.1016/j.ydbio.2006.11.002
- Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з RIPOR2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13872 (англ.) . Архів оригіналу за 8 червня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y4F9 (англ.) . Архів оригіналу за 26 липня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |