RIOX2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2XDV, 4BU2, 4BXF

Ідентифікатори

Символи

RIOX2, MDIG, MINA53, NO52, ROX, MINA, MYC-induced nuclear antigen, MYC induced nuclear antigen, ribosomal oxygenase 2, JMJD10

Зовнішні ІД

OMIM: 612049 MGI: 1914264 HomoloGene: 12071 GeneCards: RIOX2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• oxidoreductase activity • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • histone demethylase activity • identical protein binding • histone H3-methyl-lysine-4 demethylase activity • histone H3-methyl-lysine-36 demethylase activity • GO:0001106 transcription corepressor activity
Клітинна компонента	• ядерце • transcription regulator complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • histone demethylation • ремоделювання хроматину • peptidyl-arginine hydroxylation • histone H3-K4 demethylation • ribosome biogenesis • histone H3-K36 demethylation • negative regulation of nucleic acid-templated transcription
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84864


67014

Ensembl


ENSG00000170854


ENSMUSG00000022724

UniProt


Q8IUF8


Q8CD15

RefSeq (мРНК)


NM_001042533 NM_001261829 NM_032778 NM_153182


NM_025910

RefSeq (білок)


NP_001035998 NP_001248758 NP_116167 NP_694822


NP_080186

Локус (UCSC)

Хр. 3: 97.94 – 97.97 Mb

Хр. 16: 59.29 – 59.31 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RIOX2 (англ. Ribosomal oxygenase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 465 амінокислот, а молекулярна маса — 52 800^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPKKAKPTGS	GKEEGPAPCK	QMKLEAAGGP	SALNFDSPSS	LFESLISPIK
TETFFKEFWE	QKPLLIQRDD	PALATYYGSL	FKLTDLKSLC	SRGMYYGRDV
NVCRCVNGKK	KVLNKDGKAH	FLQLRKDFDQ	KRATIQFHQP	QRFKDELWRI
QEKLECYFGS	LVGSNVYITP	AGSQGLPPHY	DDVEVFILQL	EGEKHWRLYH
PTVPLAREYS	VEAEERIGRP	VHEFMLKPGD	LLYFPRGTIH	QADTPAGLAH
STHVTISTYQ	NNSWGDFLLD	TISGLVFDTA	KEDVELRTGI	PRQLLLQVES
TTVATRRLSG	FLRTLADRLE	GTKELLSSDM	KKDFIMHRLP	PYSAGDGAEL
STPGGKLPRL	DSVVRLQFKD	HIVLTVLPDQ	DQSDEAQEKM	VYIYHSLKNS
RETHMMGNEE	ETEFHGLRFP	LSHLDALKQI	WNSPAISVKD	LKLTTDEEKE
SLVLSLWTEC	LIQVV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, біогенез рибосом, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза. Локалізований у ядрі.

Література

Tsuneoka M., Koda Y., Soejima M., Teye K., Kimura H. (2002). A novel myc target gene, mina53, that is involved in cell proliferation. J. Biol. Chem. 277: 35450—35459. PMID 12091391 DOI:10.1074/jbc.M204458200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Eilbracht J., Kneissel S., Hofmann A., Schmidt-Zachmann M.S. (2005). Protein NO52 -- a constitutive nucleolar component sharing high sequence homologies to protein NO66. Eur. J. Cell Biol. 84: 279—294. PMID 15819408 DOI:10.1016/j.ejcb.2004.12.022

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19441 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q8IUF8 (англ.) . Архів оригіналу за 7 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.