REG3A

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1UV0, 2GO0, 4MTH

Ідентифікатори

Символи

REG3A, HIP, HIP/PAP, INGAP, PAP, PAP-H, PAP1, PBCGF, REG-III, REG3, regenerating family member 3 alpha

Зовнішні ІД

OMIM: 167805 MGI: 97478 HomoloGene: 130506 GeneCards: REG3A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • carbohydrate binding • identical protein binding • transmembrane signaling receptor activity • peptidoglycan binding • oligosaccharide binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • extracellular region • міжклітинний простір
Біологічний процес	• inflammatory response • multicellular organism development • negative regulation of keratinocyte differentiation • positive regulation of keratinocyte proliferation • проліферація • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • positive regulation of wound healing • acute-phase response • antimicrobial humoral response • positive regulation of cell population proliferation • response to peptide hormone • cell wall disruption in other organism • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5068


18489

Ensembl


ENSG00000172016


ENSMUSG00000071356

UniProt


Q06141


P35230

RefSeq (мРНК)


NM_138938 NM_002580 NM_138937


NM_011036

RefSeq (білок)


NP_002571 NP_620354 NP_620355


NP_035166

Локус (UCSC)

Хр. 2: 79.16 – 79.16 Mb

Хр. 6: 78.35 – 78.35 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

REG3A (англ. Regenerating family member 3 alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 175 амінокислот, а молекулярна маса — 19 395^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLPPMALPSV	SWMLLSCLML	LSQVQGEEPQ	RELPSARIRC	PKGSKAYGSH
CYALFLSPKS	WTDADLACQK	RPSGNLVSVL	SGAEGSFVSS	LVKSIGNSYS
YVWIGLHDPT	QGTEPNGEGW	EWSSSDVMNY	FAWERNPSTI	SSPGHCASLS
RSTAFLRWKD	YNCNVRLPYV	CKFTD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до антимікробних білків. Задіяний у таких біологічних процесах як запальна відповідь, гостра фаза запалення. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Секретований назовні.

Література

Itoh T., Teraoka H. (1993). Cloning and tissue-specific expression of cDNAs for the human and mouse homologues of rat pancreatitis-associated protein (PAP). Biochim. Biophys. Acta. 1172: 184—186. PMID 7679928 DOI:10.1016/0167-4781(93)90290-T
Orelle B., Keim V., Masciotra L., Dagorn J.-C., Iovanna J.-L. (1992). Human pancreatitis-associated protein. Messenger RNA cloning and expression in pancreatic diseases. J. Clin. Invest. 90: 2284—2291. PMID 1469087 DOI:10.1172/JCI116115
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Medveczky P., Szmola R., Sahin-Toth M. (2009). Proteolytic activation of human pancreatitis-associated protein is required for peptidoglycan binding and bacterial aggregation. Biochem. J. 420: 335—343. PMID 19254208 DOI:10.1042/BJ20090005
Cash H.L., Whitham C.V., Behrendt C.L., Hooper L.V. (2006). Symbiotic bacteria direct expression of an intestinal bactericidal lectin. Science. 313: 1126—1130. PMID 16931762 DOI:10.1126/science.1127119
Lasserre C., Christa L., Simon M.T., Vernier P., Brechot C. (1992). A novel gene (HIP) activated in human primary liver cancer. Cancer Res. 52: 5089—5095. PMID 1325291

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8601 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q06141 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.